Catalogo dei Corsi di studio

Formazione
2002/2005: Università di Roma La Sapienza Dottore di Ricerca in Biologia Umana.
1996/2002 Università di Roma La Sapienza Laurea in Biologia Molecolare. 110/110 cum laude

Esperienza nella ricerca scientifica:
2021-oggi Professore Associato presso l' Università di Roma "La Sapienza"
2008-2021. Ricercatore confermato all' Università di Roma La Sapienza .
2007-2008 Post-doc nel laboratorio del Prof Giuseppe Macino.
2005-2006 Vincitore di una borsa di studio della Fondazione Cenci Bolognetti.
2002-2005. Studente di dottorato nel laboratorio del Prof Macino.

Incarichi di didattica frontale:
2008-2019: Titolare del Modulo di Biologia (5 CFU, BIO/13),Corso Integrato di Biologia e Genetica, Corso di Laurea a ciclo unico in Medicina e Chirurgia (canale B) Sapienza Università di Roma.
2008-2017: Titolare del Modulo di Biologia e Genetica (2 CFU BIO/13, 1 CFU BIO/18), Corso Integrato Basi molecolari e cellulari della vita , Corso di Laurea in Tecniche Ortopediche, sede di Latina Sapienza Università di Roma
2016-2017: Corso di Biologia (3 CFU BIO/13), Corso di Laurea in Biotecnologie, Sapienza Università di Roma
2017-2019: Cell Biology I (6 CFU BIO/13), Bachelor's Degree in Bioinformatics (English course), Sapienza Università di Roma
2019-oggi: Cell Biology I (6 CFU BIO/13) and Cell Biology II (4 CFU BIO/13), Bachelor's Degree in Bioinformatics (English course), Sapienza Università di Roma
2019-oggi: Single Cell RNA seq theory and data analysis pipeline (2 CFU). Corso per gli studenti di dottorato della scuola BEMM (Sapienza Università di Roma).
2021-oggi: Modulo di Biologia, Corso Integrato Basi molecolari e cellulari della vita , CdS Infermieristica D, Sapienza Università di Roma

Compiti gestionali e organizzativi relativi alla didattica:
2008-oggi: Membro del collegio dei docenti del dottorato in Biologia Umana e Genetica (2008-2013) e del Dottorato in Biologia Umana e Genetica Medica (2014-oggi) presso l Università La Sapienza di Roma
2015-2019: Membro della Commissione Tecnico Pedagogica del Corso di Laurea a ciclo unico in Medicina e Chirurgia (canale B)
2018-oggi: membro della Commissione gestione Assicurazione Qualità del corso di Laurea Bioinformatics
Ho supervisionato circa 30 studenti durante il tirocinio di tesi e sono stato tutor di 7 dottorandi. Ho supervisionato l attività di 5 assegnisti di ricerca reclutati su miei finanziamenti.

Competenze Tecniche bio-molecolari: Northern Blot, Southern Blot, Western blot, immunoprecipitazione di proteine, PCR, qRT-PCR, clonaggio molecolare, microarray, Small RNA library cloning, colture cellulari, espressione di proteine ricombinanti, saggi di luciferasi, vettori di espressione lentivirali, genome editing (CRISPR-CAS9, ZNF nucleases)

Bioinformatica:Eccellente conoscenza del sistema operativo Linux. Perl, python and bash scripting. Database bio-molecolari (ENSEMBL,Gencode, Pubmed, SRA,GEO). R statistical analysis software (affymetrix microarray analysis(limma, oligo), Deseq2, CummeRbund, plotting packages). Allineamento e analisi di dati NGS (RNA-seq, ChIP-seq, Drop-seq) con i seguenti software: Bowtie1/2, Hisat2, MACS2, CuffLinks, bedtools, NGSplot. Metagenomica (Qiime2, metaphlan2).

Collaborazioni:
Michele Zampieri, Sapienza, Rome, Italy. Characterization of the 5mC profile of human miRNAs.
Salvatore Cucchiara, Sapienza, Rome, Italy. Metagenomic analysis o the human gut microbiome.
Tiziana Bonaldi, IEO Milan, Italy. Mass-spec characterization of AGO2 protein complexes.
Justin Stebbing, Imperial College London, UK. TP53 and AGO2 fuctional interaction.
Nikolaus Rajewsky, MDC, Berlin, Germany. Characterization of sRNAs arising from TSS and TTS sRNAs. Characterization of AGO2 KO cells by Drop-seq.

Dati bibliometrici (Scopus)

Pubblicazioni: 34

Citazioni: 4872

h-index: 19

Partecipazione a congressi in qualità di Invited Speaker:
Genetics and behaviour evolution. At Genetics School in Cortona, Italy. Neurospora crassa: a model organism to study the molecular bases of Chronobiology. 2007.
4th international CLL Workshop. 17th may 2008, Salzburg, Austria. MicroRNAs in the pathogeny of CLL .
Institute for Research in Biomedicine Bellinzona, Switzerland. The role of miRNAs in lymphocyte Biology. 29th May, 2008.
MACS Symposium "MicroRNA in physiology and disease" Bologna, Italy. miR-21 and miR-146a: regulators of lymphocyte biology. 1 st Dec 2009
EPIGEN & BLUEPRINT joint symposium: Exploring the Epigenome in Health and Disease. Rome, Italy. AGO2 and SWI/SNF cooperate to determine nucleosome occupancy at human TSS. Oct, 1st 2014.
Forum SIGENP Young Researchers, Rome, Italy. Bioinformatics in Biomedical Research. April, 16th 2018

Finanziamenti:

Epigen (The Epigenomics Flagship Project, MIUR) The epigenomic function of AGO2 protein in human cell lines .

Sapienza University of Rome: The role of AGO2 in telomere maintenance in human cells

PRIN 2017 - linea B - under 40 "SWI/SNF as a candidate modulator of YAP/TAZ transcriptional activity: implications for tumorigenesis and tissue regeneration"

Istituto Pasteur Italia - Fondazione Cenci-Bolognetti "5mC and 5hmC modification of human microRNAs"

Esperienze all' estero:
2000: Erasmus program a Gent, Belgium.
2005: Visiting Student, Tuschl Lab, Rockefeller University, New York NY, USA.