Catalogo dei Corsi di studio

ISTRUZIONE E FORMAZIONE
- 18/09/2020 - 15/06/2022 Partecipazione con conseguimento di certificato per il Percorso formativo biennale sull innovazione della didattica nell ambito del Progetto Formativo QUID per i Docenti Sapienza
- 01/2022 - Partecipazione con conseguimento di certificato per il corso di 20 ore An Introduction to EMI (English as a Medium of Instruction) erogato dal British Council per l'Università La Sapienza di Roma dal 24 gennaio al 4 febbraio 2022
- 28/03/2018 Abilitazione Scientifica Nazionale conferita per il Settore Scientifico Disciplinare BIO/10 05/E1 II Fascia.
- 7/03/2006 Dottorato di Ricerca in Biochimica, Dipartimento di Scienze Biochimiche A. Rossi Fanelli Università di Roma Sapienza
- 16/05/2002 Laurea in Chimica 110/110 Università di Roma Sapienza
CARRIERA
Dal 2/05/2022: Professore Associato Dip. Di Scienze Biochimiche A. Rossi Fanelli Università di Roma Sapienza
2/05/2019-1/05/2022: Ricercatore (RTDB) Dip. Di Scienze Biochimiche A. Rossi Fanelli Università di Roma Sapienza
1/09/2014 Senior Post-Doc Istituto Italiano di Tecnologia IIT@Sapienza, Viale regina Elena, 291 Rome
2/01/2012 Assegno di Ricerca Dip. Chimica e Tecnologia del Farmaco Università di Roma Sapienza
1/06/2009 Assegno di Ricerca Dipartimento di Scienze Biochimiche A. Rossi Fanelli Università di Roma Sapienza
1/03/2006 Post-Doc IRBM P. Angeletti Via Pontina, Pomezia
1/11/2005 Post-Doc FIRB 2003 Dipartimento di Scienze Biochimiche A. Rossi Fanelli Università di Roma Sapienza
ATTUALE ATTIVITA DI INSEGNAMENTO
- 2022/23 Nanotechnologies, Nanoparticle Applications, Biochemistry, Facoltà di Scienze, Università "Sapienza" di Roma (2cfu)
- 2022/23 Chimica e Propedeutica a Biochimica, CLMA LM-41, Facoltà di Medicina, Università "Sapienza" di Roma (2cfu)
- 2022/23 Chimica e Propedeutica a Biochimica, HT LM-41, Facoltà di Medicina, Università "Sapienza" di Roma (3cfu)
- 2022/23 Biochimica, corso di laurea in Fisioterapia (abilitante alla professione sanitaria di Fisioterapista) Bracciano - Corso di laurea H ASL Roma 4 L/SNT2 (2Cfu)
- 2022-23 Chemistry and Introduction to Biochemistry, Medicine and surgery (abilitante all'esercizio della professione di Medico Chirurgo) - Medicina e chirurgia "F" LM-41 Università "Sapienza" di Roma (2cfu)
RICONOSCIMENTI E PREMI
19/11/2012 Premio per l intuizione italiana più innovativa del 2011 nel campo delle Scienze Biomediche. Conferenza Bioeconomy di Roma
25/03/2007 RICONOSCIMENTO DI ECCELLENZA presso i laboratori di Merck Target-to-phaseIIb Symposium (Atlanta): "Crystal structures of the Hepatitis C viral proteins, NS3 protease in complex with active site inhibitors and NS5B polymerase in complex with allosteric inhibitors"
BREVETTI E TERZA MISSIONE
- Guest editor of Special Issue in Frontiers Structural Biology - Tailored Modulation of Interactions between Biomolecules: Fundamentals and Applications
- Nomina di rappresentante della Macroarea B nella Commissione Congressi e Convegni per il biennio 2021-2022 secondo delibera del Senato Accademico n.86/21 dell 8 aprile 2021;
- 29-12-2016 - Co-inventore nel brevetto "Cellular targeted active ingredient delivery system" International publication number: WO2016207257 A1
- 29 -12-2016 - Co-inventore nel brevetto "Cellular Targeted Label delivery system" International publication number: WO 2016/207256 A1
- 20/01/2009 26/06/2009 Attività di Terza Missione: PROGRAMMA FORMAZIONE ED INNOVAZIONE PER L OCCUPAZIONE Azione 4 Azioni formative e di accompagnamento per l avvio di spin-off accademici orientati all utilizzazione industriale dei risultati della ricerca universitaria Enti erogatori CONSORZIO SAPIENZA INNOVAZIONE e JUMP
ATTIVITA DI RICERCA
Malattie neurodegenerative
Questo progetto di ricerca LOCalizzazione Assistita daLlo Scattering degli aggregati fluoresCENTi dell Alzheimer - LOCALSCENT è stato finanziato con fondi POR FESR Lazio 2014-2020. Il progetto si popone lo studio e l utilizzo di cromofori ottimizzati per una diagnosi precoce dell Alzheimer. In particolare, lo studio riguarda il design, la sintesi e l analisi in fluorescenza di sonde che possano legarsi con alta affinità alle fibrille della proteina Tau, recentemente indicata come un marker biologico dell insorgenza della patologia e che sono state individuate nella retina.
Nanotecnologie, Drug Delivery
Questo progetto di ricerca riguarda lo studio di nanoparticelle proteiche ricombinanti, geneticamente modificate per incrementare le loro capacità di delivery di composti attivi verso cellule tumorali. Tale progetto è basato sull evidenza che le cellule tumorali, in seguito alla loro elevate velocità di riproduzione, richiedono un grande quantità di ferro aumentando l espressione dei recettori di membrana per la transferrina e ferritina. Le ferritine hanno una naturale conformazione a sfera cava capace di incorporare al suo interno molecole disegnate sia per il trattamento terapeutico sia per la diagnosi, schermandole al loro interno e consentendo il loro trasposto fino alle cellule tumorali limitando notevolmente la tossicità di tali composti e assicurando la loro funzionalità.
Sono stati pubblicati a livello internazionale due brevetti sul delivery di composti attivi legati alla ferritina attraverso sistemi altamente selettivi sui macrofagi. Tali sistemi basati sulle nanoparticelle basate sulla ferritina permettono di trasportare selettivamente i composti attivi sulle masse tumorali o in altre aree altamente ipossiche del paziente che sono naturalmente le zone più colpite dall azione dei macrofagi. Tali sistemi sono anche utili per il trasporto di agenti di contrasto al fine di diagnosi delle cellule tumorali e per il trattamento patologico.
Cristallografia di proteine
Durante il dottorato di ricerca e negli anni successivi, ho lavorato su progetti di biologia strutturali con lo scopo di determinare degli inibitori di enzimi della via metabolica del tripanotione, agente riducente che viene utilizzato dal parassita Leishmania che provoca una malattia altamente diffusa nei paesi del terzo mondo con un elevato tasso di mortalità. Nel 2009, il nostro Gruppo di ricerca ha scoperto I meccanismi molecolari alla base del trattamento con farmaci antimoniali ampiamente usati nel trattamento di questa malattia, risolvendo la struttura tramite diffrazione a raggi X dell enzima tripanotione riduttasi di Leishmania essenziale per lo sviluppo del parassita.
PUBBLICAZIONI
1. Capocefalo A., Gentilini S., Barolo L., Baiocco P., Conti C., Ghofraniha N.; Biosensing with free space whispering gallery mode microlasers Photonics Research, 2023, Vol11, 4, in press
2. Ardini M., Baiocco P., Di Matteo A., Giardina G., Miele A.E., Editorial in FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES Tailored Modulation of Interactions Between Biomolecules: Fundamentals and Applications , - ISSN 2296-889X. - 9:(2022), p. 961452.
3. Soloperto A., Quaglio D., Baiocco P., Romeo I., Mori M., Ardini M., Presutti C., Sannino I., Ghirga S., Iazzetti A., Ippoliti R., Ruocco G., Botta B., Ghirga F., Di Angelantonio S., Boffi A.; Rational design and synthesis of a novel BODIPY-based probe for selective imaging of tau tangles in human iPSC-derived cortical neurons Sci Rep. 2022, 12:5257, https://doi.org/10.1038/s41598-022-09016-z
4. Pediconi N., Ghirga F., Del Plato C., Peruzzi G., Athanassopoulos C. M., Mori M., Crestoni M. E., Corinti D., Ugozzoli F., Massera C., Arcovito A., Botta B., Alberto Boffi A., Quaglio D., Baiocco P., Design and synthesis of piperazine-based compounds conjugated to Humanized ferritin as delivery system of siRNA in cancer cells Bioconjugate Chem., 2021 https://doi.org/10.1021/acs.bioconjchem.1c00137
5. Di Rienzo L, Milanetti E, Testi C, Montemiglio LC, Baiocco P, Boffi A, Ruocco G. A novel strategy for molecular interfaces optimization: The case of Ferritin-Transferrin receptor interaction. Comput Struct Biotechnol J. 2020 Sep 24;18:2678-2686. doi: 10.1016/j.csbj.2020.09.020.
6. Rosito M, Testi C, Parisi G, Cortese B, Baiocco P, Di Angelantonio S. Exploring the Use of Dimethyl Fumarate as Microglia Modulator for Neurodegenerative Diseases Treatment Antioxidants 2020, 9, 700; doi:10.3390/antiox9080700
7. Pagani F, Testi C, Grimaldi A, Corsi G, Cortese B, Basilico B, Baiocco P, De Panfilis S, Ragozzino D, Di Angelantonio S. "Dimethyl Fumarate Reduces Microglia Functional Response to Tissue Damage and Favors Brain Iron Homeostasis. Neuroscience" 2019 Nov 15 pii: S0306-4522(19)30740-7
8. Macone A, Masciarelli S, Palombarini F, Quaglio D, Boffi A, Trabuco MC, Baiocco P, Fazi F, Bonamore A. Ferritin nanovehicle for targeted delivery of cytochrome C to cancer cells Sci Rep. 2019 Aug 13;9(1):11749
9. Montemiglio LC, Testi C, Ceci P, Falvo E, Pitea M, Savino C, Arcovito A, Peruzzi G, Baiocco P, Mancia F, Boffi A, des Georges A, Vallone B. Cryo-EM structure of the human ferritin-transferrin receptor 1 complex Nat Commun. 2019 Mar 8;10(1):1121
10. Calisti L., Trabuco M.C., Boffi A., Testi C., Montemiglio L.C., des Georges A., Benni I., Ilari A., Taciak B., Bia asek M., Rygiel T., Król M., Baiocco P.*, Bonamore A. Engineered ferritin for lanthanide binding PlosOne, 2018, 13(8):e0201859
11. Benni I., Trabuco M.C., Di Stasio E., Arcovito A., Boffi A., Malatesta F., Bonamore A., De Panfilis S., de Turris., Baiocco P. Excimer based fluorescent pyrene ferritin conjugate for protein oligomerization studies and imaging in living cells RSC Adv., 2018, 8, 12815 12822
12. de Turris V., Cardoso Trabuca M., Peruzzi G., Boffi A., Testi C., Vallone B., Montemiglio LC., Des Georges A., Calisti L., Benni I., Bonamore A., Baiocco P. Humanized archaeal ferritin as a tool for cell targeted delivery Nanoscale. 2017, 9, 647-655
13. Calisti L., Benni I, Trabuco C.M., Baiocco P, Ruzicka B, Boffi A., Falvo E., Malatesta F., Bonamore A., Probing bulky ligand entry in engineered Archael Ferritins. Biochim Biophys Acta. 2017, 1861, 450-456
14. Baldassarre L, Giliberti V, Rosa A, Ortolani M, Bonamore A, Baiocco P, Kjoller K, Calvani P, Nucara A. Mapping the amide I absorption in single bacteria and mammalian cells with resonant infrared nanospectroscopy. Nanotechnology. 2016 Feb 19;27(7):075101.
15. Ilari A, Fiorillo A, Baiocco P, Poser E, Angiulli G, Colotti G. Targeting polyamine metabolism for finding new drugs against leishmaniasis: a review. Mini Rev Med Chem. 2015;15(3):243-52. Review.
16. Nicoletti FP, Bustamante JP, Droghetti E, Howes BD, Fittipaldi M, Bonamore A, Baiocco P, Feis A, Boffi A, Estrin DA, Smulevich G. Interplay of the H-bond donor-acceptor role of the distal residues in hydroxyl ligand stabilization of Thermobifida fusca truncated hemoglobin. Biochemistry. 2014 Dec 30;53(51):8021-30.
17. Patrizi B, Lapini A, Di Donato M, Marcelli A, Lima M, Righini R, Foggi P, Baiocco P, Bonamore A, Boffi A. Role of local structure and dynamics of small ligand migration in proteins: a study of a mutated truncated hemoprotein from Thermobifida fusca by time resolved MIR spectroscopy. J Phys Chem B. 2014 Aug 7;118(31):9209-17.
18. Colotti G, Baiocco P, Fiorillo A, Boffi A, Poser E, Chiaro FD, Ilari A. Structural insights into the enzymes of the trypanothione pathway: targets for antileishmaniasis drugs. Future Med Chem. 2013 Oct;5(15):1861-75. Review.
19. Colotti G, Ilari A, Fiorillo A, Baiocco P, Cinellu MA, Maiore L, Scaletti F, Gabbiani C, Messori L. Metal-based compounds as prospective antileishmanial agents: inhibition of trypanothione reductase by selected gold complexes. ChemMedChem. 2013 Oct;8(10):1634-7.
20. Baiocco P, Poce G, Alfonso S, Cocozza M, Porretta GC, Colotti G, Biava M, Moraca F, Botta M, Yardley V, Fiorillo A, Lantella A, Malatesta F, Ilari A. Inhibition of Leishmania infantum trypanothione reductase by azole-based compounds: a comparative analysis with its physiological substrate by X-ray crystallography. ChemMedChem. 2013 Jul;8(7):1175-83.
21. Fiorillo A., Colotti G., Boffi A., Baiocco P., Ilari A.: The crystal structures of the tryparedoxin-tryparedoxin peroxidase couple unveil the structural determinants of Leishmania detoxification pathway PLoS Negl Trop Dis. 2012 Aug;6(8):e1781. Epub 2012 Aug 21
22. Ilari A, Baiocco P, Messori L, Fiorillo A, Boffi A, Gramiccia M, Di Muccio T, Colotti G.: A gold-containing drug against parasitic polyamine metabolism: the X-ray structure of trypanothione reductase from Leishmania infantum in complex with auranofin reveals a dual mechanism of enzyme inhibition. Amino Acids. 2012, 42, 803-11
23. Baiocco P. & Ilari A., Ceci P., Orsini S., Gramiccia M., Di Muccio T., Colotti G.: Inhibitory effect of silver nanoparticles on Trypanothione Reductase activity and Leishmania infantum proliferation ACS Med. Chem. Letters 2011, 2, 230-233
24. Narjes. F., Crescenzi B., Ferrara M., Habermann J., Colarusso S., Rico Ferreira M., Stansfield I., Mackay A., Conte I., Ercolani C., Zaramella S., Palumbi M. C., Meuleman P., Leroux-Roels G., Giuliano C., Fiore F., Di Marco S., Baiocco P., Koch U., Migliaccio G., Altamura S., Laufer R., De Francesco R. and Rowley M.: Discovery of MK-3281, a Potent Non-Nucleoside Finger-Loop Inhibitor of the Hepatitis C Virus NS5B Polymerase. J. Med. Chem., 2011, 54, 289 301
25. Bonamore A., Rovardi I., Gasparrini F., Baiocco P., Barba M., Molinaro C., Botta B., Boffi A., Macone A.: An enzymatic, stereoselective synthesis of (S)-norcoclaurine Green Chem., 2010, 12, 1623-1627
26. Baiocco P. & Colotti G., Franceschini S., Ilari A.: Molecular basis of antimony treatment in Leishmaniasis. J. Med. Chem., 2009, 52, 2603-12
27. Baiocco P., Franceschini S., Ilari A., Colotti G.: Trypanothione reductase from Leishmania infantum: cloning, expression, purification, crystallization and preliminary X-ray data analysis. Protein & Peptide Letters, 2009, 16, 196-200
28. Gourlay L. J., Angelucci F., Baiocco P., Boumis G., Brunori M., Bellelli A., Miele A. E.: The Three-dimensional Structure of Two Redox States of Cyclophilin A from Schistosoma mansoni: evidence for redox regulation of peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity. J. Biol. Chem., 2007, 282(34), 24851-7
29. Baiocco P. & Gourlay L. J., Angelucci F., Fontaine J., Hervè M., Miele A. E., Trottein F., Brunori M., Bellelli A.: Probing the mechanism of GSH activation in Schistosoma haematobium Glutathione S-Transferase by site-directed mutagenesis and X-ray crystallography. J. Mol. Biol., 2006, 360,678-89
30. Angelucci F., BaioccoP., Gourlay L. J. , Morea V., Brunori M., Bellelli A.: Insights into catalytic mechanism of Glutathione S-Transferase. The lesson from Schistosoma haematobium. Structure, 2005, 13, 1241-1246
31. Annunziatini C., Baiocco P., Gerini M. F., Lanzalunga O., Sjögren B.: "Aryl Substituted N-Hydroxyphtalimides as mediators in the laccase-catalysed oxidation of lignin model compounds and delignification of wood pulp. Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic, 2005, 32, 89-96
32. Angelucci F., Johnson K. A., Baiocco P., Miele A. E., Brunori M., Valle C., Vigorosi F., Troiani A., Liberti P., Cioli D., Klinkert M. Q., Bellelli A.: Schistosoma mansoni fatty acid binding protein: specifity and function control as revealed by cristallographic structure. Biochemistry 2004, 43, 13000-11
33. Baiocco P., Barreca A.M., Fabbrini M., Galli C., Gentili P.: Promoting laccase activity towards non-phenolic substrates: a mechanistic investigation with some laccase/mediator systems. Org. Biomol. Chem., 2003, 1, 191-197
34. D Acunzo F., Baiocco P., Galli C.: A study of the oxidation of ethers with the enzyme laccase under mediation by two N-OH-type compounds. New J. Chem ., 2003, 27, 329-332
35. D Acunzo F., Baiocco P., Fabbrini M., Galli C., Gentili P.: The radical rate-determining step in the oxidation of benzyl alcohols by two N-OH-type mediators of laccase: the polar N-oxyl radical intermediate. New J. Chem., 2002, 26, 1791-1794
36. D Acunzo F., Baiocco P., Fabbrini M., Galli C., Gentili P. A mechanistic survey of the oxidation of alcohols and ethers with the enzyme laccase and mediation by TEMPO. Eur. J. Org. Chem., 2002, 4195-4201