Ritratto di Daniela.Debiase@uniroma1.it

AGGIORNAMENTO del 14 marzo 2021:

Il Comitato Regionale delle Università del Lazio ha deliberato che a partire da lunedì 15 marzo 2021 sono applicate le seguenti disposizioni:
È sospesa la frequenza in presenza delle attività formative e curriculari di tutti i corsi di studio (lauree, lauree magistrali, master, corsi di dottorato), che proseguiranno a distanza.

 

Le lezioni di Biochimica I e quelle di tutti gli altri insegnamenti del I anno-II semestre proseguono quindi a distanza attraverso il link usato finora per accedere da remoto all'aula 10 di Latina (Corso della Repubblica).

 

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Studenti I anno Corso di Laurea Magistrale in Medicina e Chirurgia "E"- Polo Pontino a.a. 2020-2021

Stante il perdurare della situazione pandemica e fino a diversa comunicazione, la modalità di erogazione dell'Insegnamento di Biochimica I (codice insegnamento 1026210) sarà "blended", come da indicazioni dell'Ateneo e da indicazioni del Corso di Laurea Magistrale in Medicina e Chirurgia E. 

Le lezioni si svolgeranno il lunedì (11:30-13:30 e 14:30-16:30) - giovedì (14:30-16:30) come da calendario pubblicato e allegato.

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Idoneità Biochimica I:

- Per sostenere l'idoneità di Biochimica I è necessario avere ottenuto almeno il 67% delle presenze alle lezioni (in presenza e/o a distanza) e prenotarsi in E-learning entro la data indicata.

- Per motivi organizzativi, le prenotazioni all'idoneità di Biochimica I verranno aperte, per ogni appello, circa un mese prima e chiuse circa 5 giorni prima della data dell'appello in questione.

- Vista la complessità dell'organizzazione di esami e idoneità online, prenotazioni tardive non saranno accettate.

Ulteriori istruzioni saranno disponibili a tempo debito in E-Learning al link: https://elearning.uniroma1.it/enrol/index.php?id=631.

 

L'idoneità consiste di 10 quesiti di cui:

- 5 a scelta multipla (2 punti/quesito)

- 5 quesiti con risposta a scelta multipla, ma dove la risposta che si ritiene corretta va anche motivata (4 punti/quesito: 2 per la risposta corretta e max 2 per la motivazione). Saranno disponibili 10-15 righe per scrivere la motivazione. Nota bene: la motivazione verrà valutata solo se la risposta data al quesito è corretta.

 

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Students Ist  year Degree Medicine and Surgery "F"- International Medical School a.y. 2020-2021

Given the  the "Coronavirus pandemic" phase, the Biochemistry I course (code 1038227) will be blended, following the rules provided by the University and the Coordination of the Degree Course.

 

Daniela De Biase classes will take place on Friday 7th May (14:30-16:30) - Tuesday 11th May (14:30-16:30) - Wednesday 12th May (16:30-18:30) - Friday 14th May (9:00-11:00) - Tuesday 18th May  (14:30-16:30).

 

Updated information from teachers can be retrieved at the link: https://elearning.uniroma1.it/enrol/index.php?id=421. 

 

 

 

 

 

giovedì ore 10-12 (Latina)
venerdì ore 14-15 (Roma)

E' preferibile contattare preventivamente il docente via e-mail per definire l'orario e quindi evitare attese

Curriculum di studi e accademico di Daniela De Biase
2010- ad oggi: Professore Associato di Biochimica (BIO/10), Sapienza Università di Roma, Dip. di Scienze e Biotecnologie Medico-Chirurgiche (Latina- Polo Pontino);
2010: 1 mese-Professore Visitatore presso Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée - Ecole Normale Supérieure (ENS) de Cachan-France;
2001-2010: Professore Associato di Biochimica (BIO/10), Sapienza Università di Roma, Dip. di Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli"
1991-2001: Ricercatore, Sapienza Università di Roma, Dip. di Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli"
1991: Ph.D in Biochemistry, conseguito presso University of Wales, College of Cardiff, Cardiff (UK) (oltre 3 anni di permanenza all'estero);
1987: Laurea in Scienze Biologiche(110/110 e lode) conseguita presso Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
1983: Diploma di maturità classica (56/60) conseguito presso il liceo classico statale "Giulio Cesare" di Roma.

Attività didattica in Sapienza (attualmente svolge 12 CFU) ripartiti tra i seguenti corsi:
2012-ad oggi: 5 CFU negli insegnamenti di Biochemistry I e II, Corso F-International Medical School (insegnamento ed esami svolti completamente in inglese);
2000-ad oggi: 4 CFU nell'insegnamento di Biochimica I, Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (sede Polo Pontino-Latina);
2012-ad oggi: 1 CFU nell'insegnamento di Chimica e Propedeutica Biochimica, Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (sede Polo Pontino-Latina);
2008-ad oggi: 2 CFU di Biochimica nell'Insegnamento "Basi Molecolari e Cellulari della Vita", Laurea triennale in Ostetricia "A" (sede Policlinico Umberto I-Roma);

Attività Istituzionali di Coordinamento Didattico (sin dalla loro istituzione):
1) Componente del Gruppo del riesame e gruppo AQ del Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza sede di Latina);
2) Membro della Commissione Tecnico-Pedagogica (CTP) per il Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza sede di Latina);
3) Coordinatore di semestre per il I anno-II semestre nel corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza, sede di Latina);
4) Coordinatore e Presidente di Commissione d'esame dell'Insegnamento "Basi Molecolari della Vita" Corso di Laurea in Fisioterapia (Sapienza, sede di Ariccia);
5) Coordinatore e Presidente di Commissione d'esame dell'Insegnamento "Basi Molecolari della Vita" Corso di Laurea in Logopedia (Sapienza, sede di Ariccia);
6) Coordinatore e Presidente di Commissione d'esame dell'Insegnamento "Basi Molecolari e cellulari della Vita" Corso di Laurea in Ostetricia (Sapienza, sede Policlinico Umberto I);
7) Coordinatore dell'insegnamento Biochemistry II nel corso di Laurea in Medicine and Surgery "F", International Medical School (Sapienza);
8) Coordinatore dell'insegnamento Biochimica I nel corso di Laurea in Medicina e Chirurgia "E" (Sapienza, sede di Latina);

9) 2012-ad oggi: Membro del Collegio di Dottorato in "Scienze della Vita" ("Life Sciences").

10) 2018: Membro della Commissione di Ateneo "24-CFU" per settore BIO/10 per il riconoscimento dei crediti formativi dei candidati all'insegnamento nelle scuole superiori di I e II grado.
11) 2018: Membro della Commissione "Don't miss your chance-DMYC" per la selezione di laureati stranieri al primo ciclo per l'ammissione a corsi di laurea magistrale in Sapienza.
12) 2018: Membro della Commissione area CUN-05 per l'assegnazione di borse di perfezionamento all'estero per laureati di Sapienza.

Erasmus e Internazionalizzazione:
2018- ad oggi: Membro della Commissione internazionalizzazione della Facoltà di Farmacia e Medicina (area medica; su nomina del Preside)
2017-ad oggi: Coordinatore Accademico della Mobilità Internazionale (CAM) per la Facoltà di Farmacia e Medicina di Sapienza (area Medica; su nomina del Preside);
2017-ad oggi: Membro del Comitato Erasmus Traineeship di Sapienza (comitato interfacoltà);
Erasmus Agreement promoter:
2013-2014: Sapienza-Ecole Normale Supérieure de Cachan (France);
2014-2020: Sapienza-University of Eastern Finland (Kuopio, Finland);
2018-2021: Sapienza - Cardiff University (UK).
2018-2021: Sapienza - Radboud University Nijmegen (Netherlands)
2018-2021: Sapienza - Maribor Facoltà di Medicina (Slovenia)
2020-2021: Sapienza - Università di Porto, Facoltà di Medicina (Portogallo)
2020-2021: Sapienza - Università di Vilnius, Facoltà di Medicina (Lituania)

Educazione e training in Ricerca:
1986: Svolge un internato formativo di 6 mesi presso l'Istituto Superiore di Sanità a Roma nel gruppo di Virologia guidato dal Prof. Giovanni Battista Rossi nell'ambito di ricerche sull'HIV/AIDS. Acquisisce competenze nell'isolamento del virus da pazienti e nella coltivazione di linfociti.
1986-1987: Prosegue il suo percorso di formazione nella ricerca lavorando come studente interno in tesi presso il Dip. di Scienze Biochimiche di Sapienza sotto la guida dei Professori Donatella Barra e Francesco Bossa. Si dedica allo studio della determinazione della struttura primaria di proteine e peptidi bioattivi (in collaborazione con il Prof. Vittorio Erspamer) acquisendo competenze in HPLC e utiluzzo di sequenziatori di proteine (gas-phase Edman).
1988-1991: Nell'ambito di un European Project, Human Capital and Mobility (equivalente ad una delle attuali Marie Sklodowska-Curie Actions), si trasferisce per 3 anni a Cardiff (Biochemistry Dept., University of Wales, College of Cardiff, Cardiff (UK)) dove porterà avanti il suo progetto di dottorato su "I meccanismi di inattivazione di enzimi PLP-dipendenti (GABA-transaminasi, ornitina transaminasi) da parte di inibitori basati sul meccanismo". Supervisor: Prof. R.A. John. Durante questo periodo acquisisce competenze nella purificazione dei suddetti enzimi da organi animali e perfeziona le sue conoscenze enzimologiche e di tecniche spettroscopiche (UV-visibile, CD, fluorescenza).

Ha trascorso diversi brevi periodi di ricerca all'estero: Biozentrum (Basel, Switzerland; 1991), IPK (Gatersleben, Germany; 1994), Biochemistry Dpt, Univ College Cardiff (Cardiff, UK; 1995).

Dal 1988 si dedica allo studio dei rapporti struttura funzione in GABA-transaminasi (di mammifero) e glutammato decarbossilasi (batterica e umana).
Dal 1997-ad oggi: studia la regolazione dell'espressione genica in particolare dei geni del sistema gad coinvolti nella risposta allo stess acido estremo nel batterio modello Escherichia coli. In questo periodo espande il suo campo di ricerche alla Fisiologia microbica e allo studio delle interazioni DNA-proteina.

Ad oggi ha laureato più di 30 studenti Master/specialistica (in tesi per 18 mesi) ed è stata supervisor/co-supervisor/tutor di 9 dottorandi.

Pubblicazioni e attività Editoriali e di reviewing:
Daniela De Biase è co-authore di oltre 60 pubblicazioni su riviste e libri a diffusione internazionale (2017 Scopus h-index=23). Ha depositato tre brevetti italiani (con Sapienza).

Daniela De Biase svolge attività di reviewer per molte riviste scientifiche, come ad esempio: Molecular Microbiology, Infection and Immunity, Virulence, Biochemistry, Biotechnology and Bioengeneering, FEBS Journal, Enzyme and Microbial Technology. Questa attività è certificata da Publons: https://publons.com/author/462106/daniela-de-biase#stats.

E' valutatore di progetti per BBSRC (UK), ANR (France) e Università Italo-Francese (UIF).

Membro di Board Editoriale di riviste internazionali:
1) Frontiers in Microbiology (Associate Editor per la Sezione Microbial Physiology and Metabolism) http://journal.frontiersin.org/journal/microbiology/section/microbial-ph...
2) AIMS Microbiology http://www.aimspress.com/journal/microbiology

Organizzazione di Conferenze Internazionali:
Organizzatore del 2018 EFB meeting Microbial Stress: from System to Molecules and back (http://www.efb-central.org/index.php/microbial_stress/)
Organizzatore del 2019 Advanced Course "Trends in enzymology and Biocatalysis (https://teb2019.azuleon.org/)

Affiliazioni a Società scientifiche :
1989- ad oggi: SIB (Società Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare);
2009- ad oggi: ASM (American Society for Microbiology)
2017- ad oggi: Microbiology Society (UK)
2016- ad oggi: Board Member della Microbial Physiology Section dell'European Federation of Biotechnology (EFB), http://www.efb-central.org/index.php/microbialphysiology/C61.

Principali Linee di Ricerca:
Microbiologia-Biologia Molecolare: regolazione trascrizionale e biochimica del sistema Gad, il più potente sistema di acido-resistenza (AR) in Escherichia coli (commensale e pathogeno) e in molti altri batteri enterici.
Interconnessioni tra i differenti sistemi AR e altri processi fisiologici in E. coli ed altri batteri enterici.
Nuove molecole di origine naturale e sintetica come potenziali antibiotici.
Biochimica: Esperto in enzimi PLP-dipendenti, in particolare glutammato decarbossilasi (GAD) e GABA-transaminasi (GABA-T) di origine batterica e di mammifero.
Biotechnologia: Ingegnerizzazione di GAD per applicazioni Biotech.

Finanziamenti per la ricerca come PI (dal 2014):
1) 2014 "Ruolo degli enzimi preposti al metabolismo del GABA in lievito in condizioni di stress, durante l'invecchiamento e nell'apoptosi" Progetto di Ricerca di Università C26A14ZSMB, 1 anno: 10.000,00;
2) 2015 "Cross-talks between acid resistance and virulence determinants in Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC)" Project Galileo n. G14-137, Université Franco-Italienne, 1 anno: 2.800,00 (solo per mobilità);
3) 2015 "Structure and conformational changes in GadX, a global transcriptional regulator in Escherichia coli" BIOSTRUCTX_9162 BioStruct-X Single Project. Progetto per accedere alle Facilities di PETRA III- Sincrotrone di Hamburg.
4) 2015-2017 " Beyond acid resistance: Role of bacterial -aminobutyrate (GABA) in community and host interactions" PROGRAMMES TRANSVERSAUX DE RECHERCHE - PTR 2015 finanziato da Pasteur Institute (Paris, France). PI: Prof Jean-Marc Ghigo al Pasteur; 2 anni: 246.000,00 (di cui 112.000,00 al co-PI: Prof. Daniela De Biase).
5) 2017 "Sulfur-containing amino acids and their derivatives: from chemical and bio-based synthesis to the investigation of their biological activities" Progetto di Ricerca di Università RM11715C813C7E84, 1 anno: 10.000,00;
6) 2018-2019 "Whole transcriptome (RNA-Seq) combined with biochemical studies to evaluate the contribution of the metabolism of glutamate and GABA in Mycobacterium tuberculosis strains circulating in Salvador, Bahia, Brazi" (in collaborazione con l'istituti FIOCRUZ, Brasile) finanziato da Istituto Pasteur- Fondazione Cenci Bolognetti, 2-anni: 15.000,00/anno;
7) 2018 "Sulfur-containing amino acids and their derivatives: from chemical and bio-based synthesis to the investigation of their biological activities" Progetto di Ricerca di Università RM118164308E05B2, 1 anno: 10.000,00.
8) 2019 "Investigation of the biological activities of carbon-phosphorus and carbon-sulfur containing amino acids and of their derivatives, obtained by chemical synthesis and biocatalysis" Progetto di Ricerca di Università RM11916B861B9985. 1 anno: 10.000,00.

Collaborazioni Internazionali in corso:
Dr. Silvie Rimsky, College de France, Paris, France.
Dr. Alessandra Occhialini, IRIM, University of Montpellier, France.
Dr Alex Khomutov, Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia.
prof. Jouko Vepsalainen, School of Pharmacy, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland.
Prof. John Blanchard, Albert Einstein, College of Medicine, New York, USA.
Dr. Theolis Barbosa, Fiocruz Institute, Fundacao Oswaldo Cruz, Instutute Pasteur, Brazil.
Dr. Ana Varela Coelho, ITQB Nova Univeristy of Lisbon, Portugal.

Seminari su invito (dal 2015):
1. 2020: "Die or survive under very low pH stress: when an amino acid can make the difference" COST CA18113 Open meeting. Lisbon 12-14 February 2020 (invited speaker)
2. 2016: Catalytic mechanism and structural organization of Escherichia coli Glutamate Decarboxylase V Congress of the Russian Biochemical Society- V CIS Congress on Physiology, Sochi Dagomys, Russia October 4 9, 2016 (invited speaker).
3. 2015: Acid stress resistance of gut bacteria: characterization of the GadX regulon in Escherichia coli Collège de France Paris (seminar upon invitation; November 30, 2015).
4. 2015: Role of the glutamate decarboxylase (GAD)-dependent system of Brucella spp. in the resistance to extreme acid stress . Microbial Stress: From Molecules to Systems. Sitges, Spain 12-15 November, 2015 (selected speaker).
5. 2015: Glutamate decarboxylase from neutralophilic bacteria: from biochemistry, to physiology and biotechnology The Francis Crick Institute - Mill Hill Laboratory. London, UK; May 7, 2015 (seminar upon invitation)

Insegnamento Codice Anno Corso - Frequentare
BASI MOLECOLARI E CELLULARI DELLA VITA 1034944 2021/2022 Ostetricia (abilitante alla professione sanitaria di Ostetrica/o) - Corso di laurea A - Roma Azienda Policlinico Umberto I
CHIMICA E PROPEDEUTICA BIOCHIMICA 1025530 2021/2022 Medicina e chirurgia "E" (abilitante all'esercizio della professione di Medico Chirurgo) - Polo Pontino
BIOCHIMICA 1026210 2021/2022 Medicina e chirurgia "E" (abilitante all'esercizio della professione di Medico Chirurgo) - Polo Pontino
BIOCHEMISTRY 1038227 2021/2022 Medicine and surgery (abilitante all'esercizio della professione di Medico Chirurgo) - Medicina e chirurgia "F"
CHIMICA E PROPEDEUTICA BIOCHIMICA 1025530 2020/2021 Medicina e chirurgia "E" Polo Pontino
BASI MOLECOLARI E CELLULARI DELLA VITA 1034944 2020/2021 Ostetricia (abilitante alla professione sanitaria di Ostetrica/o) - Corso di laurea A - Roma Azienda Policlinico Umberto I
BIOCHIMICA 1026210 2020/2021 Medicina e chirurgia "E" Polo Pontino
BIOCHEMISTRY 1038227 2020/2021 Medicine and surgery - Medicina e chirurgia "F"
BIOCHEMISTRY 1038227 2020/2021 Medicine and surgery - Medicina e chirurgia "F"
CHIMICA E PROPEDEUTICA BIOCHIMICA 1025530 2019/2020 Medicina e chirurgia "E" Polo Pontino
BASI MOLECOLARI E CELLULARI DELLA VITA 1034944 2019/2020 Ostetricia (abilitante alla professione sanitaria di Ostetrica/o) ROMA - Corso di laurea A - Azienda Policlinico Umberto I
BIOCHEMISTRY 1038227 2019/2020 Medicine and surgery - Medicina e chirurgia "F"
BIOCHIMICA 1026210 2019/2020 Medicina e chirurgia "E" Polo Pontino
BASI MOLECOLARI DELLA VITA 1034829 2018/2019 Logopedia (abilitante alla professione sanitaria di Logopedista) ARICCIA - Corso di laurea B - ASL Roma 6 - Ariccia (RM)
BASI MOLECOLARI E CELLULARI DELLA VITA 1034944 2018/2019 Ostetricia (abilitante alla professione sanitaria di Ostetrica/o) ROMA - Corso di laurea A - Azienda Policlinico Umberto I
BASI MOLECOLARI DELLA VITA 1034829 2018/2019 Fisioterapia (abilitante alla professione sanitaria di Fisioterapista) ARICCIA - corso di laurea E - ASL Roma 6 - Ariccia (RM)
CHIMICA E PROPEDEUTICA BIOCHIMICA 1025530 2018/2019 Medicina e chirurgia 'E'
BIOCHEMISTRY 1038227 2018/2019 Medicine and Surgery
BIOCHIMICA 1026210 2018/2019 Medicina e chirurgia 'E'
METODOLOGIA MEDICO SCIENTIFICA PRE-CLINICA 1056190 2018/2019 Medicina e chirurgia 'E'
BASI MOLECOLARI DELLA VITA 1034829 2017/2018 Fisioterapia (abilitante alla professione sanitaria di Fisioterapista) ARICCIA - corso di laurea E - ASL Roma 6 - Ariccia (RM)
BASI MOLECOLARI E CELLULARI DELLA VITA 1034944 2017/2018 Ostetricia (abilitante alla professione sanitaria di Ostetrica/o) ROMA - Corso di laurea A - Azienda Policlinico Umberto I
CHIMICA E PROPEDEUTICA BIOCHIMICA 1025530 2017/2018 Medicina e chirurgia 'E'
BIOCHIMICA 1026210 2017/2018 Medicina e chirurgia 'E'
BIOCHEMISTRY 1038227 2017/2018 Medicina e chirurgia 'F'
BASI MOLECOLARI DELLA VITA 1034829 2016/2017 Fisioterapia (abilitante alla professione sanitaria di Fisioterapista) ARICCIA - corso di laurea E - ASL Roma 6 - Ariccia (RM)
BASI MOLECOLARI DELLA VITA 1034829 2016/2017 Logopedia (abilitante alla professione sanitaria di Logopedista) ARICCIA - Corso di laurea B - ASL Roma 6 - Ariccia (RM)
BASI MOLECOLARI E CELLULARI DELLA VITA 1034944 2016/2017 Ostetricia (abilitante alla professione sanitaria di Ostetrica/o) ROMA - Corso di laurea A - Azienda Policlinico Umberto I
CHIMICA E PROPEDEUTICA BIOCHIMICA 1025530 2016/2017 Medicina e chirurgia 'E'
BIOCHEMISTRY 1038227 2016/2017 Medicina e chirurgia 'F'
BIOCHIMICA 1026210 2016/2017 Medicina e chirurgia 'E'
Titolo Rivista Anno
Editorial. Microbial stress. From sensing to intracellular and population responses FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 2020
Understanding how micro-organisms respond to acid pH is central to their control and successful exploitation FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 2020
Enzymatic kinetic resolution of desmethylphosphinothricin indicates that phosphinic group is a bioisostere of carboxyl group COMMUNICATIONS CHEMISTRY 2020
Microbial stress. From sensing to intracellular and population responses 2020
Management of chronic stable angina: modern microbiomedical research provides insights into Traditional Chinese Medicine treatments JOURNAL OF CARDIOVASCULAR PHARMACOLOGY 2020
Advanced course trends in enzymology and biocatalysis 2019
Lethality of Brucella microti in a murine model of infection depends on the wbkE gene involved in O-polysaccharide synthesis VIRULENCE 2019
Biochemical characterization of Glutamate decarboxylase from Mycobacterium tuberculosis 2018
Glutaminase activity and glutamine-dependent acid resistance in enteric bacteria 2018
Effect of temperature, pH and plasmids on in vitro biofilm formation in Escherichia coli ACTA NATURAE 2018
The glutaminase-dependent acid resistance system. Qualitative and quantitative assays and analysis of its distribution in enteric bacteria FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 2018
On the effect of alkaline pH and cofactor availability in the conformational and oligomeric state of Escherichia coli glutamate decarboxylase PROTEIN ENGINEERING, DESIGN & SELECTION 2017
The yhiM gene codes for an inner membrane protein involved in GABA export in Escherichia coli AIMS MICROBIOLOGY 2017
Glutamate decarboxylase in bacteria 2017
The Glutaminase-dependent system confers extreme acid resistance to new species and atypical strains of Brucella FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 2017
Biochemical characterization of a variant of Escherichia coli glutamate decarboxylase with improved GABA production at alkaline pH. 2017
Role of the glutamine-dependent acid resistance system of Brucella spp. in response to extreme acid stress 2017
Bicyclic γ-amino acids as inhibitors of γ-aminobutyrate aminotransferase JOURNAL OF ENZYME INHIBITION AND MEDICINAL CHEMISTRY 2016
Convenient syntheses of phosphinic analogues of γ-aminobutyric- and glutamic acids RUSSIAN JOURNAL OF BIOORGANIC CHEMISTRY 2016
Acid survival mechanisms in neutralophilic bacteria 2016