Catalogo dei Corsi di studio

Il corso ha l'obiettivo di fornire agli studenti una formazione pratica e teorica sui più comuni modelli e strumenti di analisi dei dati "omici" in biologia e medicina molecolare. L'attesa è che dopo aver completato il corso lo studente sia in grado di analizzare ed interpretare dati su larga scala come , per esempio, i dati di trascrittomica di un paziente utilizzando una metodologia appropriata implementata con matlab. Inoltre, lo studente sarà in grado di capire la teoria biologica alla base delle tecniche di analisi e di analizzarne criticamente i risultati.

Programma

1 - Introduzione alla bioinformatica
2 - Introduzione alla biologia
3 - Banche dati biologiche
4 - UCSC Genome Browser e Table Browser
5 - Richiami di Statistica descrittiva
6 - Test di ipotesi e test ipergeometrico
7 - Arricchimenti di una lista di geni
8 - Introduzione ad R e Rstudio
9 - Biomart con R
10 - Introduzione al TCGA
11 - Introduzione all'NGS
12 - Elementi di teoria delle reti
13 - Pratica

Testi adottati

slide fornite a lezione

Bibliografia di riferimento

letteratura di riferimento fornita a lezione

Prerequisiti

Conoscenza di informatica di base.

Modalità di svolgimento

Il corso prevede sia una parte teorica che una parte pratica. Lo studente usera', quando possibile, il proprio computer. Verranno assegnati dei compiti a casa che dovranno essere consegnati entro la fine del corso.

Modalità di frequenza

La frequenza al corso e' facoltativa

Modalità di valutazione

Lo studente dovra' consegnare un progetto concordato con il docente.
L'esame finale riguardera' la discussione orale del progetto scelto.
La valutazione finale riflettera' sia il giudizio sul lavoro svolto a casa riguardante i compiti assegnati durante il corso,
sia un giudizio sulle capacita' dello studente di ragionamento, di sintesi e di lavoro autonomo.