STRUTTURA, BIOSINTESI E ANALISI DELLE PROTEINE

Obiettivi formativi

Obiettivi generali Illustrare principi avanzati di struttura e strutturazione delle proteine e dei loro complessi macromolecolari. Rendere abili gli studenti alla presentazione/divulgazione/discussione delle relazioni struttura-funzione di proteine. Introdurli alle conoscenze attuali sulle “macchine molecolari”. Obiettivi specifici • Conoscenze preliminari Lo studente che affronta questo corso deve possedere nozioni di base di biochimica delle proteine (indispensabile), biologia molecolare (indispensabile), genetica (importante) e biologia cellulare (importante). • Conoscenze dello studente alla fine del corso: Con questo corso gli studenti acquisiscono competenze sia sulla complessa serie di eventi dinamici che conducono le catene polipeptidiche neoformate ad assumere strutture e funzioni biologiche, che conoscenze delle strategie sperimentali nello studio delle strutture proteiche. • Capacità acquisite dello studente con questo corso Al termine del corso lo studente sarà in grado di interrogare le basi dati di coordinate 3D e di utilizzare programmi di grafica molecolare nella descrizione di strutture proteiche. • Capacità critiche e di giudizio acquisite a fine corso Lo studente saprà discutere in modo competente relazioni struttura-funzione di specifiche proteine, interpretare in chiave strutturale le conseguenze biologiche delle mutazioni genetiche, e affrontare la progettazione di strutture proteiche modificate. • Capacità di comunicazione sui contenuti del corso Lo studente sarà valutato, oltre che sulla base delle conoscenze acquisite, anche sulle sue abilità nell’utilizzo di programmi di grafica molecolare, per scopi sia divulgativi che speculativi. • Capacità di proseguire in modo autonomo Dalla conoscenza dei temi trattati, lo studente avrà acquisito quelle competenze e quel background culturale necessari ad affrontare un’ampia gamma di problemi concernenti la Biochimica delle Proteine.

Canale 1
MARIA CARMELA BONACCORSI DI PATTI Scheda docente

Programmi - Frequenza - Esami

Programma
Principi base della struttura delle proteine e della loro biosintesi. Relazioni struttura/funzione dei principali motivi strutturali ad alfa elica, a foglietto beta e a composizione mista (principi associativi tra elementi di struttura secondaria, connettività ed elementi di connessione strutturati e destrutturati, principi di topologia proteica) e alcuni esempi di rilevanza biologica. Cenni sul processo di strutturazione delle proteine in vitro e in vivo. Richiami sulle principali tecniche di determinazione e di predizione della struttura tridimensionale delle proteine, di analisi e simulazione del processo di strutturazione, della caratterizzazione di interazioni proteina-proteina in vivo e in vitro. Approfondimento delle relazioni struttura/funzione in sistemi proteici specifici (proteine di membrana, complessi multienzimatici, metalloproteine).
Prerequisiti
Lo studente che affronta questo corso deve possedere nozioni di base di biochimica delle proteine (indispensabile), biologia molecolare (indispensabile), genetica (importante) e biologia cellulare (importante).
Testi di riferimento
Il testo di riferimento è M. Williamson 'Come Funzionano le Proteine', ed. Zanichelli. Altro materiale didattico è pubblicato dal docente nel sito didattico Elearning2 alla pagina web http://elearning2.uniroma1.it
Modalità insegnamento
Il corso prevede l’approfondimento di aspetti strutturali della biochimica delle proteine, che saranno trattati in un totale di 20 lezioni frontali, e attività pratiche a piccoli gruppi, per un massimo di 12 ore a studente.
Frequenza
Frequenza non obbligatoria delle lezioni frontali e delle attività pratiche. Per assicurare il raggiungimento degli obiettivi anche agli studenti non frequentanti, saranno messi a disposizione in modalità “a distanza” (pagina eLearning del corso) test di autovalutazione dei propri saperi minimi e le copie di tutte le lezioni frontali.
Modalità di esame
La valutazione finale sarà basata principalmente su una prova pratica in cui lo studente entro 20 minuti dovrà dimostrare di saper utilizzare i database delle strutture 3D i programmi di grafica molecolare per descrivere un sistema proteico a propria scelta. Nella valutazione dell'esame pratico la determinazione del voto finale terrà conto sia della originalità nella scelta del sistema proteico che delle funzioni di grafica molecolare utilizzate. Inoltre attraverso una prova orale, centrata sulla discussione di un dettaglio molecolare del sistema proteico prescelto dallo studente, sarà possibile valutare anche più generalmente i raggiungimenti degli obiettivi del corso più legati alla conoscenza dei principi di strutturazione proteica in vitro e in vivo. Nella valutazione dell’esame orale sarà particolarmente rilevante l'impiego di un linguaggio appropriato. Originalità del sistema proteico prescelto e un numero significativo di funzioni di grafica molecolare utilizzate nella prova pratica è condizione necessaria per il raggiungimento di una valutazione pari a 25. Valutazioni superiori verranno attribuite agli studenti le cui due prove soddisfano tutti e quattro gli aspetti sopra elencati (originalità del sistema proteico prescelto, funzioni della grafica molecolare utilizzate, conoscenza dei principi di strutturazione proteica e appropriato linguaggio).
Modalità di erogazione
lezioni frontali e attività a piccoli gruppi
  • Codice insegnamento1012882
  • Anno accademico2024/2025
  • CorsoGenetica e Biologia Molecolare - Genetics and Molecular Biology
  • CurriculumGenetica e Biologia Molecolare (percorso valido anche ai fini del conseguimento del doppio titolo italo-francese)
  • Anno1º anno
  • Semestre2º semestre
  • SSDBIO/10
  • CFU6
  • Ambito disciplinareDiscipline del settore biomolecolare