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Bioinformatics: Biology of the Cell I
CORSO DI LAUREA IN INFERMIERISTICA "E" ASL ROMA 1 - OSPEDALE S. SPIRITO
Orari di ricevimento
mercoledì mattina ore 11.00 -13.00 o altro orario da concordare. Sia per il mercoledì mattina che per altri orari è raccomandato annunciarsi sempre tramite e-mail poichè occasionalmente anche il mercoledì, per ragioni di servizio (sedute di tesi, congressi) potrei non essere in ufficio.
Curriculum
Carriera e titoli
2002 Consegue la Laurea in Biologia Molecolare riportando la votazione di 110/110 e lode
2006 Consegue il Titolo di Dottore di Ricerca in Biologia Umana e Genetica
2008 Vince il Concorso per un posto di Ricercatore Universitario nel SSD BIO/13
2021 Professore associato SSD BIO/13
Attività Didattica
2008-2019 Modulo di Biologia (5 CFU) nel Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia B presso la Sapienza Università di Roma
2009-2016 Modulo di Biologia (2 CFU) Presso il CDL Tecnici Ortopedici, Polo Pontino, Sapienza Università di Roma
2016/17 Biologia Cellulare (3 CFU) presso il CdL in Biotecnologie, Sapienza Università di Roma
2017-2025 Cell Biology, CdS in Bioinformatics, Sapienza Università di Roma
2022-2025 Modulo Biologia Cellulare (2 CFU) CdS Infermieristica E Sapienza Università di Roma
2022-2025 Modulo Biologia Cellulare (2 CFU) CdS Infermieristica M Sapienza Università di Roma
Attività Scientifica
2002-2005 PhD student: Svolge ricerche nel campo della Biologia Molecolare, studiando i meccanismi di trasduzione del segnale luminoso nel fungo filamentoso “Neurospora crassa”. Contribuisce a chiarire il ruolo dell'enzima Protein Kinasi C (PKC) nella trasduzione del segnale recepito dal fotorecettore WC-1.
2005-2008 Post-Doc: Si occupa di caratterizzare il ruolo dei microRNA nelle patologie Leucmiche. In collaborazione con il laboratorio di Thomas Thuschl, presso la Rockefeller University di New York, caratterizza il profilo di espressione dei miRNA in Leucemia Linfocitica Cronica.
2008-2011 Ricercatore: Si dedica allo studio del ruolo dei miRNAs nella Attivazione dei Linfociti T, caratterizzando il ruolo di queste piccole molecole nel modulare la risposta immunitaria.
2012-2021 Ricercatore: Si dedica allo studio della funzione epigenetica della proteina AGO2 tramite una integrazione di metodi high-troughput (NGS) e computazionali
2021-oggi Professore associato: si dedica allo sviluppo di strumenti bioinformatici per l’analisi si “single cell RNA-seq” e “ spatially resolved trascriptomics”
Pubblicazioni:
1: Verduci L, Azzalin G, Gioiosa S, Carissimi C, Laudadio I, Fulci V, Macino G. microRNA-181a enhances cell proliferation in acute lymphoblastic leukemia by targeting EGR1. Leuk Res. 2015 Jan 28. pii: S0145-2126(15)00027-2. doi:10.1016/j.leukres.2015.01.010. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 25740602.
2: Tavolaro S, Colombo T, Chiaretti S, Peragine N, Fulci V, Ricciardi MR, Messina M, Bonina S, Brugnoletti F, Marinelli M, Di Maio V, Mauro FR, Del Giudice I, Macino G, Foà R, Guarini A. Increased chronic lymphocytic leukemia proliferation upon IgM stimulation is sustained by the upregulation of miR-132 and miR-212. Genes Chromosomes Cancer. 2015 Apr;54(4):222-34. doi: 10.1002/gcc.22236. Epub 2015 Feb 2. PubMed PMID: 25645730.
3: Carissimi C, Laudadio I, Cipolletta E, Gioiosa S, Mihailovich M, Bonaldi T, Macino G, Fulci V. ARGONAUTE2 cooperates with SWI/SNF complex to determine nucleosome occupancy at human Transcription Start Sites. Nucleic Acids Res. 2015 Feb 18;43(3):1498-512. doi: 10.1093/nar/gku1387. Epub 2015 Jan 20. PubMed PMID:25605800.
4: Carissimi C, Carucci N, Colombo T, Piconese S, Azzalin G, Cipolletta E, Citarella F, Barnaba V, Macino G, Fulci V. miR-21 is a negative modulator of T-cell activation. Biochimie. 2014 Dec;107 Pt B:319-26. doi: 10.1016/j.biochi.2014.09.021. Epub 2014 Oct 7. PubMed PMID: 25304039.
5: Montalban E, Mattugini N, Ciarapica R, Provenzano C, Savino M, Scagnoli F, Prosperini G, Carissimi C, Fulci V, Matrone C, Calissano P, Nasi S. MiR-21 is an Ngf-modulated microRNA that supports Ngf signaling and regulates neuronal degeneration in PC12 cells. Neuromolecular Med. 2014 Jun;16(2):415-30. doi:10.1007/s12017-014-8292-z. Epub 2014 Feb 4. PubMed PMID: 24492999; PubMed Central PMCID: PMC4019824.
6: Frampton AE, Castellano L, Colombo T, Giovannetti E, Krell J, Jacob J, Pellegrino L, Roca-Alonso L, Funel N, Gall TM, De Giorgio A, Pinho FG, Fulci V, Britton DJ, Ahmad R, Habib NA, Coombes RC, Harding V, Knösel T, Stebbing J, Jiao LR. MicroRNAs cooperatively inhibit a network of tumor suppressor genes to promote pancreatic tumor growth and progression. Gastroenterology. 2014 Jan;146(1):268-77.e18. doi:10.1053/j.gastro.2013.10.010. Epub 2013 Oct 9. PubMed PMID: 24120476.
7: Lucherini OM, Obici L, Ferracin M, Fulci V, McDermott MF, Merlini G, Muscari I, Magnotti F, Dickie LJ, Galeazzi M, Negrini M, Baldari CT, Cimaz R, Cantarini L. First report of circulating microRNAs in tumour necrosis factor receptor-associated periodic syndrome (TRAPS). PLoS One. 2013 Sep 16;8(9):e73443. doi: 10.1371/journal.pone.0073443. eCollection 2013. PubMed PMID: 24066048; PubMed Central PMCID: PMC3774691.
8: Sebastiani GD, Fulci V, Niccolini S, Giannitti C, Bugatti S, Minisola G, Barnaba V, Scappucci G, Macino G, Galeazzi M. Over-expression of miR-223 in T-lymphocytes of early rheumatoid arthritis patients. Clin Exp Rheumatol. 2011 Nov-Dec;29(6):1058-9. Epub 2011 Dec 22. PubMed PMID: 22032299.
9: Cocco E, Paladini F, Macino G, Fulci V, Fiorillo MT, Sorrentino R. The expression of vasoactive intestinal peptide receptor 1 is negatively modulated by microRNA 525-5p. PLoS One. 2010 Aug 10;5(8):e12067. doi:10.1371/journal.pone.0012067. PubMed PMID: 20706588; PubMed Central PMCID:PMC2919398.
10: Curtale G, Citarella F, Carissimi C, Goldoni M, Carucci N, Fulci V, Franceschini D, Meloni F, Barnaba V, Macino G. An emerging player in the adaptive immune response: microRNA-146a is a modulator of IL-2 expression and activation-induced cell death in T lymphocytes. Blood. 2010 Jan 14;115(2):265-73. doi: 10.1182/blood-2009-06-225987. Epub 2009 Nov 12. PubMed PMID: 19965651.
11: Fulci V, Scappucci G, Sebastiani GD, Giannitti C, Franceschini D, Meloni F, Colombo T, Citarella F, Barnaba V, Minisola G, Galeazzi M, Macino G. miR-223 is overexpressed in T-lymphocytes of patients affected by rheumatoid arthritis. Hum Immunol. 2010 Feb;71(2):206-11. doi: 10.1016/j.humimm.2009.11.008. Epub 2009 Nov 18. PubMed PMID: 19931339.
12: Fulci V, Colombo T, Chiaretti S, Messina M, Citarella F, Tavolaro S, Guarini A, Foà R, Macino G. Characterization of B- and T-lineage acute lymphoblastic leukemia by integrated analysis of MicroRNA and mRNA expression profiles. Genes Chromosomes Cancer. 2009 Dec;48(12):1069-82. doi: 10.1002/gcc.20709. PubMed PMID:19760605.
13: Carissimi C, Fulci V, Macino G. MicroRNAs: novel regulators of immunity. Autoimmun Rev. 2009 May;8(6):520-4. doi: 10.1016/j.autrev.2009.01.008. Epub 2009 Feb 4. Review. PubMed PMID: 19200459.
14: Landgraf P, Rusu M, Sheridan R, Sewer A, Iovino N, Aravin A, Pfeffer S, Rice A, Kamphorst AO, Landthaler M, Lin C, Socci ND, Hermida L, Fulci V, Chiaretti S, Foà R, Schliwka J, Fuchs U, Novosel A, Müller RU, Schermer B, Bissels U, Inman J,Phan Q, Chien M, Weir DB, Choksi R, De Vita G, Frezzetti D, Trompeter HI, Hornung V, Teng G, Hartmann G, Palkovits M, Di Lauro R, Wernet P, Macino G, Rogler CE, Nagle JW, Ju J, Papavasiliou FN, Benzing T, Lichter P, Tam W, Brownstein MJ, Bosio A, Borkhardt A, Russo JJ, Sander C, Zavolan M, Tuschl T. A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing. Cell. 2007 Jun 29;129(7):1401-14. PubMed PMID: 17604727; PubMed Central PMCID: PMC2681231.
15: Fulci V, Macino G. Quelling: post-transcriptional gene silencing guided by small RNAs in Neurospora crassa. Curr Opin Microbiol. 2007 Apr;10(2):199-203.Epub 2007 Mar 28. Review. PubMed PMID: 17395524.
16: Fulci V, Chiaretti S, Goldoni M, Azzalin G, Carucci N, Tavolaro S, Castellano L, Magrelli A, Citarella F, Messina M, Maggio R, Peragine N, Santangelo S, Mauro FR, Landgraf P, Tuschl T, Weir DB, Chien M, Russo JJ, Ju J, Sheridan R, Sander C, Zavolan M, Guarini A, Foà R, Macino G. Quantitative technologies establish a novel microRNA profile of chronic lymphocytic leukemia. Blood. 2007 Jun 1;109(11):4944-51. Epub 2007 Feb 27. PubMed PMID: 17327404.
17: Franchi L, Fulci V, Macino G. Protein kinase C modulates light responses in Neurospora by regulating the blue light photoreceptor WC-1. Mol Microbiol. 2005 Apr;56(2):334-45. PubMed PMID: 15813728.