Programma
Origine della vita: il mondo prebiotico e l' evoluzione chimica. La chimica del carbonio: gruppi funzionali. Architettura cellulare: l'organizzazione, la struttura e la composizione delle cellule eucariotiche e procariotiche; ruolo funzionale degli organelli subcellulari. Proprieta' chimico-fisiche dell'acqua: struttura, solvatazione, legami idrogeno, interazioni idrofobiche, interazioni di van der Walls, legami ionici, proprieta' colligative, osmosi, diffusione, ionizzazione, chimica acido-base, pH, pK, sistemi tamponi, tamponi biologici del fosfato e del carbonato. Nucleotidi ed acidi nucleici: struttura e funzione. Struttura e funzione degli amminoacidi: Struttura e funzione degli amminoacidi standard e di alcuni amminoacidi non standard, ionizzazione e proprieta' acido-base degli amminoacidi. Proteine: legame peptidico, struttura primaria, secondaria, terziaria, quaternaria, strutture supersecondarie, denaturazione e ripiegamento delle proteine, struttura e funzione della cheratina, fibroina, collagene, immunoglobuline; struttura e funzione della mioglobina e dell'emoglobina, struttura dell'eme, curve di saturazione della mioglobina e della emoglobina, allosteria, cooperativita', effetto Bohr, trasporto dell'anidride carbonica, emoglobine patologiche. Catalisi enzimatica: proprieta' generali degli enzimi, energia di attivazione, meccanismi di catalisi enzimatica, cinetica di reazione dello stato stazionario, equazione di Michelis-Menten, grafico dei doppi reciproci. Inibizione enzimatica. Meccanismi di regolazione dell'attivita' enzimatica. Coenzimi e vitamine: struttura e funzione del NAD e NADP, FMN, FAD (nelle forme ossidate e ridotte) vitamina A, C, D, E, K, acido lipoico, piridossal fosfato, tiamina pirofosfato, biotina, acido pantotenico, folati, S-adenosil metionina. Carboidrati: struttura e funzione dei monosaccaridi, disaccaridi, polisaccaridi e glicoconiugati, ruolo degli oligosaccaridi nel riconoscimento e nell’ adesione cellulare; i determinanti antigenici dei gruppi sanguigni, lectine, glicoproteine. Lipidi: struttura e funzione degli acidi grassi, triacilgliceroli, glicerofosfolipidi, sfingolipidi, prostaglandine, steroli. Lipoproteine. Membrane cellulari: struttura ed organizzazione delle membrane, micelle e doppi strati lipidici, zattere lipidiche, caveole, meccanismi generali della fusione di membrane, proteine di membrana. Meccanismi di trasporto attraverso le membrane: ionofori, canali, pompe, trasportatori del glucosio, ATPasi di tipo P, F, V, trasportatori ABC. Biosegnalazione: tipi generali di trasduttori di segnale, canali ionici controllati dal voltaggio per il K+ , Na+, Ca+2, canale ionico del recettore dell'acetil colina, recettori enzimtici, linee generali della regolazione genica e dell'attivazione della glicogeno sintasi da parte dell'insulina, recettori accoppiati a proteine G e a secondi messaggeri, AMP ciclico, Ca+2, fosfolipasi c, trasduzione del segnale dell'adrenalina, meccanismo generale di regolazione dell'espressione genica da parte degli ormoni steroidei, il meccanismo della visione. Introduzione al metabolismo: le leggi della termodinamica, energia libera, ruolo dei nucleotidi trifosfati e dei composti fosforilati ad alta energia, reazioni di ossido-riduzione. Metabolismo dei carboidrati: le reazioni della glicolisi, della fermentazione alcolica e lattica, la via del pentosio fosfato, della sintesi e della demolizione del glicogeno, glicogenina, gluconeogenesi. Ciclo dell'acido citrico: il ciclo dell'acido citrico, struttura e funzione del coenzima A, complesso della piruvato deidrogenasi, ruolo del ciclo dell'acido citrico nell'anabolismo. Trasporto degli elettroni e fosforilazione ossidativa: catena di trasferimento degli elettroni nel mitocondrio, sintesi mitocondriale ATP, termogenesi. Metabolismo dei lipidi: assorbimento lipidico: chilomicroni e lipoproteine, ossidazione degli acidi grassi saturi, linee generali dell'ossidazione degli acidi grassi insaturi o con un numero dispari di atomi di carbonio, corpi chetonici e loro metabolismo, biosintesi degli acidi grassi, biosintesi del colesterolo, linee generali della biosintesi dei triacilgliceroli, dei fosfolipidi di membrana. Metabolismo degli amminoacidi e delle proteine: digestione delle proteine ed assorbimento degli amminoacidi, catabolismo dei gruppi amminici. Escrezione dell'azoto e ciclo dell'urea. Linee generali del catabolismo degli amminoacidi. Linee generali della biosintesi degli amminoacidi. La sintesi dei neurotrasmettitori e degli ormoni. Metabolismo dei nucleotidi: linee generali della sintesi e della degradazione dei nucleotidi purinici e pirimidinici.
Prerequisiti
Al fine di comprendere i contenuti della Biochimica e conseguire gli obiettivi di apprendimento sono fondamentali le conoscenze della matematica, della fisica, della chimica inorganica, della chimica organica e della biologia insegnate nei primi anni del corso di Laurea in Farmacia.
Testi di riferimento
Voet D, Voet J, Pratt CW “Fondamenti di biochimica” Zanichelli
Devlin, TM "Biochimica" Edises
Nelson DL, Cox M "I principi di biochimica di Lehninger" Zanichelli
Siliprandi, Tettamanti "Biochimica medica: strutturale, metabolica e funzionale" Piccin
Garrett RH, Grisham CM " Biochimica" Piccin
Modalità insegnamento
Lezioni in aula per un totale di 104 ore secondo l'orario stabilito dal Consiglio del Corso di Studio, di cui 56 erogate dal docente Fabio Altieri.
Dettaglio delle lezioni:
Parte introduttiva (4 ore)
Basi di biologia e chimica organica
Bioenergetica. Acqua, pH e tamponi
Struttura e funzioni proteine (12 ore)
Struttura amminoacidi, legame peptidico, peptidi funzionali
Struttura tridimensionale proteine: struttura primaria, secondaria e strutture supersecondarie
Struttura terziaria e quaternaria. Il folding proteico
Proteine destrutturate, prioni, fibroina, cheratina, collagene
Elastina, immunoglobuline, proteine coniugate
Mioglobina, emoglobina
Enzimi e catalisi (6 ore)
Catalisi enzimatica. Gli enzimi e meccanismo di azione
Cinetica dello stato stazionario. Equazione di Micaelis-Menten. Inibizione enzimatica.
Controllo dell’attività enzimatica. Enzimi allosterici. Modifiche covalenti
Struttura e funzioni glucidi (5 ore)
Monosaccaridi e disaccaridi
Polisaccaridi e glicoconiugati
Struttura e funzioni nucleotidi (6 ore)
Nucleotidi: struttura e funzioni. Gli acidi nucleici.
Struttura e proprietà del DNA. Topoisomerasi
Organizzazione dei genomi. Struttura e funzione dell’RNA. Codice genetico
Struttura e funzioni dei lipidi e membrane biologiche (5 ore)
Lipidi: classificazione e struttura. Acidi grassi saturi e insaturi.
Struttura dei principali lipidi biologici (trigliceridi, fosfolipidi, gangliosidi, colesterolo)
Membrane biologiche: struttura e funzione
Trasporto di membrana: attivo, passivo, facilitato
Vitamine e coenzimi (4 ore)
Vitamine idrosolubili e coenzimi
Vitamine liposolubili
Metabolismo Glucidi (10 ore)
Metabolismo concetti generali. Glicolisi I parte
Glicolisi II parte, Regolazione glicolisi, destino piruvato
Gluconeogenesi
Sintesi e degradazione del glicogeno
Metabolismo ossidativo (12 ore)
Il metabolismo ossidativo: Destini del piruvato. Complesso della piruvato deidrogenasi.
Il ciclo di Krebs
Ciclo di Krebs. Fosforilazione ossidativa. Trasportatori elettronici
Fosforilazione ossidativa. Riduzione dell’ossigeno e sintesi di ATP
Disaccoppianti. Reazioni anaplerotiche. Sistemi navetta. Via dei pentosi
Metabolismo lipidi (8 ore)
Catabolismo dei lipidi. Trasporto lipidico. Degradazione degli acidi grassi. Beta ossidazione
Corpi chetonici. Destini del citrato e trasporto citosolico. Biosintesi degli acidi grassi.
Biosintesi degli acidi grassi. Biosintesi fosfolipidi e colesterolo Le lipoproteine plasmatiche
Metabolismo aminoacidi (4 ore)
Metabolismo aa: Transaminazione
Metabolismo aa: ciclo urea
Biosegnalazione e biochimica degli ormoni (12 ore)
Biosegnalazione I parte
Biosegnalazione II parte
Biochimica degli ormoni: Ormoni peptidici
Biochimica degli ormoni: Ormoni steroidei
Recettori ormonali
Funzioni degli acidi nucleici (12 ore)
Replicazione del DNA
Replicazione del DNA
La trascrizione: RNA polimerasi e fattori di trascrizione
Regolazione della trascrizione
La sintesi proteica: ribosomi e fattori proteici
La sintesi proteica: attivazione tRNA e fase di inizio
La sintesi proteica: allungamento e fase di termine
Test in aula e ripasso (4 ore)
Frequenza
Sebbene facoltativa il docente consiglia una frequenza attiva per il raggiungimento degli obiettivi formativi del corso.
Modalità di esame
Colloquio alla fine del corso per appurare l’acquisita conoscenza della struttura delle macromolecole biologiche, del metabolismo cellulare e delle principali vie di segnalazione cellulari. Per superare l'esame lo studente deve dimostrare di avere almeno acquisito una conoscenza sufficiente della strutture delle proteine e degli acidi nucleici, del loro funzionamento e delle principali vie metaboliche, sia cataboliche che anaboliche (glicolisi, ciclo di Krebs, fosforilazione ossidativa, sintesi e degradazione degli acidi grassi, ciclo dell'urea e metabolismo del glicogeno). Per conseguire punteggi superiori al minimo lo studente deve dimostrare un grado di conoscenza maggiore degli argomenti trattati nel corso e essere in grado di collegarli in modo logico e coerente.
Modalità di erogazione
Lezioni in aula per un totale di 104 ore secondo l'orario stabilito dal Consiglio del Corso di Studio, di cui 56 erogate dal docente Fabio Altieri.
Dettaglio delle lezioni:
Parte introduttiva (4 ore)
Basi di biologia e chimica organica
Bioenergetica. Acqua, pH e tamponi
Struttura e funzioni proteine (12 ore)
Struttura amminoacidi, legame peptidico, peptidi funzionali
Struttura tridimensionale proteine: struttura primaria, secondaria e strutture supersecondarie
Struttura terziaria e quaternaria. Il folding proteico
Proteine destrutturate, prioni, fibroina, cheratina, collagene
Elastina, immunoglobuline, proteine coniugate
Mioglobina, emoglobina
Enzimi e catalisi (6 ore)
Catalisi enzimatica. Gli enzimi e meccanismo di azione
Cinetica dello stato stazionario. Equazione di Micaelis-Menten. Inibizione enzimatica.
Controllo dell’attività enzimatica. Enzimi allosterici. Modifiche covalenti
Struttura e funzioni glucidi (5 ore)
Monosaccaridi e disaccaridi
Polisaccaridi e glicoconiugati
Struttura e funzioni nucleotidi (6 ore)
Nucleotidi: struttura e funzioni. Gli acidi nucleici.
Struttura e proprietà del DNA. Topoisomerasi
Organizzazione dei genomi. Struttura e funzione dell’RNA. Codice genetico
Struttura e funzioni dei lipidi e membrane biologiche (5 ore)
Lipidi: classificazione e struttura. Acidi grassi saturi e insaturi.
Struttura dei principali lipidi biologici (trigliceridi, fosfolipidi, gangliosidi, colesterolo)
Membrane biologiche: struttura e funzione
Trasporto di membrana: attivo, passivo, facilitato
Vitamine e coenzimi (4 ore)
Vitamine idrosolubili e coenzimi
Vitamine liposolubili
Metabolismo Glucidi (10 ore)
Metabolismo concetti generali. Glicolisi I parte
Glicolisi II parte, Regolazione glicolisi, destino piruvato
Gluconeogenesi
Sintesi e degradazione del glicogeno
Metabolismo ossidativo (12 ore)
Il metabolismo ossidativo: Destini del piruvato. Complesso della piruvato deidrogenasi.
Il ciclo di Krebs
Ciclo di Krebs. Fosforilazione ossidativa. Trasportatori elettronici
Fosforilazione ossidativa. Riduzione dell’ossigeno e sintesi di ATP
Disaccoppianti. Reazioni anaplerotiche. Sistemi navetta. Via dei pentosi
Metabolismo lipidi (8 ore)
Catabolismo dei lipidi. Trasporto lipidico. Degradazione degli acidi grassi. Beta ossidazione
Corpi chetonici. Destini del citrato e trasporto citosolico. Biosintesi degli acidi grassi.
Biosintesi degli acidi grassi. Biosintesi fosfolipidi e colesterolo Le lipoproteine plasmatiche
Metabolismo aminoacidi (4 ore)
Metabolismo aa: Transaminazione
Metabolismo aa: ciclo urea
Biosegnalazione e biochimica degli ormoni (12 ore)
Biosegnalazione I parte
Biosegnalazione II parte
Biochimica degli ormoni: Ormoni peptidici
Biochimica degli ormoni: Ormoni steroidei
Recettori ormonali
Funzioni degli acidi nucleici (12 ore)
Replicazione del DNA
Replicazione del DNA
La trascrizione: RNA polimerasi e fattori di trascrizione
Regolazione della trascrizione
La sintesi proteica: ribosomi e fattori proteici
La sintesi proteica: attivazione tRNA e fase di inizio
La sintesi proteica: allungamento e fase di termine
Test in aula e ripasso (4 ore)