Orari di ricevimento
Martedì 10-11
Curriculum
Parte I – Informazioni generali
Nome completo SERENA RINALDO
Data di nascita 20/06/1977
Luogo di nascita ROMA
Cittadinanza ITALIANA
Telefono +390649910713
E-mail serena.rinaldo@uniroma1.it
Lingue parlate ITALIANO, INGLESE
Posizione attuale:
• Ricercatore a Tempo Determinato art. 24 c.3-b L. 240/10 SC 05/E2 SSD BIO/11 presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche “A. Rossi Fanelli”- Sapienza Università di Roma.
Parte II – Formazione
• 2002 Laurea cum laude in Scienze biologiche - indirizzo biomolecolare Sapienza Università di Roma
• 2006 Dottorato in Biochimica, Titolo delle tesi - 'N-oxides sensing in Pseudomonas aeruginosa: characterization of DNR, a transcriptional regulator', Docente guida Prof. Maurizio Brunori.
Parte III – Titoli ed incarichi
IIIA – Accademici
• 2015-2016 Dip. Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli" - Sapienza Università di Roma. Assegno di Ricerca (1 anno): “BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY OF CYCLIC DI-GMP AND QUORUM SENSING SIGNALING PATHWAYS IN PSEUDOMONAS AERUGINOSA” (Assegno di ricerca - Legge 240/2010)
• 2015-2016 Docente a titolo oneroso presso la Facoltà di Farmacia e Medicina della Sapienza, Università di Roma, per i seguenti corsi: Biochimica, Biochimica clinica e Biologia molecolare clinica – Corso di Laurea Tecniche della prevenzione nell’ ambiente e nei luoghi di lavoro (TITOLARE DEL CORSO INTEGRATO) A.S.L. Frosinone- 2CFU SSD BIO/10, BIO/12, Chimica e propedeutica biochimica - Corso di Laurea in Tecniche di Radiologia Medica, per Immagini e Radioterapia (TITOLARE DEL CORSO INTEGRATO) A.O. Forlanini-San Camillo - 2CFU SSD BIO/10
• 2012-2015 Dip. Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli" - Sapienza Università di Roma.Ricercatore a tempo determinato - t.pieno (art. 24 c.3-a L. 240/10)
• 2009-2012 Facoltà di Medicina e Chirurgia e Dip. Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli" - Sapienza Università di Roma. Assegno di Ricerca (3 anni): Proteins from human pathogens: a structural biology project. (Assegno di ricerca - Legge 449/1997)
• 2005-2008 Dip. Scienze Biochimiche "A. Rossi Fanelli" - Sapienza Università di Roma. Contratto di ricerca Post-dottorato: "Post-genomic structural biology". Principal Investigator: Prof. Maurizio Brunori.
IIIB – Altro
• 2018- 2024 Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca (MIUR)Abilitazione Scientifica Nazionale Biochimica (05/E1 - SSD BIO/10) – Professore di seconda fascia
• 2015- 2021 Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca (MIUR)Abilitazione Scientifica Nazionale Biologia Molecolare (05/E2 - SSD BIO/11) – Professore di seconda fascia
• 2012-2016 Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca (MIUR)Coordinatore nazionale e responsabile di unità del progetto FIRB-FUTURO IN RICERCA 2010 RBFR10LHD1, finanziato dal MIUR.
• 2007 ESTACIÓN EXPERIMENTAL DEL ZAIDÍN Consejo Superior de Investigaciones Científicas - Granada (E) Short term scientific mission per collaborazioni estere (COST Action 856) con Prof. Eulogio Bedmar, nell'ambito del progetto di collaborazione "Nitric oxide sensing in P. aeruginosa: the DNA binding activity of the DNR transcription factor assayed by Isothermal titration calorimetry (ITC)"
• 2004 Free University of Amsterdam (NL) Short term scientific mission per collaborazioni estere (COST Action 856 e Societa' Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare -SIB) con Dott. Rob van Spanning nell'ambito del progetto di collaborazione "Heterologous DNR-mediated nitric oxide signaling in Escherichia coli and in Paracoccus denitrificans"
• 2002 Università degli studi della Tuscia: Abilitazione alla professione di Biologo per superamento dell’esame di Stato
Parte IV – Attività didattica
Didattica frontale attualmente in corso c/o Sapienza Universita' di Roma
• 2017- Bioinformatica e Proteomica – Corso di Laurea in Biotecnologie Farmaceutiche – 3 CFU BIO/11
• 2017- Biochimica – Corso di Laurea in medicina e Chirurgia “A” - 2CFU SSD BIO/10, BIO/11
• 2015- Biochimica, Biochimica clinica e Biologia molecolare clinica – Corso di Laurea Tecniche della prevenzione nell’ ambiente e nei luoghi di lavoro (TITOLARE DEL CORSO INTEGRATO) - 2CFU SSD BIO/10, BIO/12,
• 2014- Chimica e propedeutica biochimica - Corso di Laurea in Tecniche di Radiologia Medica, per Immagini e Radioterapia (TITOLARE DEL CORSO INTEGRATO) - 2CFU SSD BIO/10
Parte V. Finanziamenti per attività di ricerca
PI-principal investigator
• 2017 MIUR Finanziamento annuale individuale delle attività base di ricerca
• 2017 Sapienza - Universita' di Roma Nucleotide signalling in prokaryotes and eukaryotes: from proteins to metabolic networks
• 2012 -2016 MIUR - FIRB-FUTURO IN RICERCA 2010 - BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY OF CYCLIC DI-GMP AND QUORUM SENSING SIGNALING PATHWAYS IN PSEUDOMONAS AERUGINOSA. RBFR10LHD1; Coordinatore nazionale e Responsabile di Unità di Ricerca (4 anni, € 453300).
Parte VI – Attività scientifica e competenze tecniche
L’attività scientifica di Serena Rinaldo è incentrata sull’analisi dei meccanismi molecolari che controllano l’attività di proteine coinvolte in processi biologici cruciali per l’omeostasi e il mantenimento della cellula al fine di chiarire i meccanismi molecolari che portano a condizioni patologiche. L’analisi della relazione struttura-funzione di proteine chiave in processi cellulari complessi e importanti, quali le infezioni croniche o i tumori, è condotta attraverso un approccio multidisciplinare che vede l’integrazione della biochimica, della biologia molecolare e della biologia strutturale.
La realizzazione di questi obiettivi è stata possibile grazie all’esperienza specifica acquisita dalla Dott.ssa Rinaldo nella biochimica di proteine (enzimi e fattori di trascrizione) redox, coinvolte nella sintesi e percezione dell’ossido nitrico, attraverso studi di ingegneria proteica, cinetica rapida, spettroscopia e tecniche di biofisica molecolare quali la microcalorimetria per lo studio di interazioni molecolari. Nell'ambito di quest'ultimo approccio, la Dott.ssa Rinaldo ha contribuito alla realizzazione e alla gestione di una facility di microcalorimetria ITC presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche (Sapienza).
Parte VII - Conferenze
Participazione a 19 congressi nazionali ed internazionali, con 8 presentazioni orali (O) e 9 poster (P) a seguito di selezione dell'abstract.
INVITED SPEAKER
• 2016 1st Workshop Microcal – Alfatest – Cinisello Balsamo (MI)
• 2015 31st Meeting of the Italian Society of General Microbiology and Microbial Biotechnology 23-25 Settembre 2015 (Ravenna) (http://www.simgbm.it/index.html)
• 2014 Seminario per la scuola di Dottorato in Biochimica (Sapienza, University of Rome): “An innovative tool to study biomolecule interactions in solution: isothermal titration calorimetry”
Parte VIII – Prodotti della Ricerca
(ORCID ID: 0000-0003-0682-023X)
1. Cutruzzolà, F., Giardina, G., Marani, M., Macone, A., Paiardini, A., Rinaldo, S., Paone, A. Glucose metabolism in the progression of prostate cancer (2017) Frontiers in Physiology, 8 (FEB), art. no. 97
2. Italia Anna Asteriti, Frederick Daidone, Gianni Colotti, Serena Rinaldo, Patrizia Lavia,Giulia Guarguaglini and Alessandro Paiardini “Identification of small molecule inhibitors of the Aurora-A/TPX2 complex”. In Press: ONCOTARGET 2017
3. S. Rinaldo, G. Giardina, F. Mantoni, A. Paiardini, A. Paone, F. Cutruzzolà Discovering selective diguanylate cyclases inhibitors: from PleD to discrimination of the active site of cyclic-di-GMP phosphodiesterases. In Press: Methods in Molecular Biology
4. Marani M, Paone A, Fiascarelli A, Macone A, Gargano M, Rinaldo S, Giardina G, Pontecorvi V, Koes D, McDermott L, Yang T, Paiardini A, Contestabile R, Cutruzzolà F. (2016) A pyrazolopyran derivative preferentially inhibits the activity of human cytosolic hydroxymethyltransferase and induces cell death in lung cancer cells. Oncotarget. 7, 4570-83. doi: 10.18632/oncotarget.6726.
5. Vishnu Pawar S, Messina M, Rinaldo S, Cutruzzolà F, Kaever V, Rampioni G, Leoni L. (2015) Novel genetic tools to tackle c-di-GMP-dependent signaling in Pseudomonas aeruginosa. J Appl Microbiol. 120, 205-217. doi: 10.1111/jam.12984.
6. Fernicola S, Torquati I, Paiardini A, Giardina G, Rampioni G, Messina M, Leoni L, Del Bello F, Petrelli R, Rinaldo S, Cappellacci L, Cutruzzolà F (2015) Synthesis of triazole-linked analogues of c-di-GMP and their interactions with diguanylate cyclase. JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. 58, 8269-84. doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b01184
7. Fernicola S., Paiardini A., Giardina G., Rampioni G., Leoni L., Cutruzzolà F. and Rinaldo S. (2015) In silico discovery and in vitro validation of catechol-containing sulfonohydrazide compounds as potent inhibitors of the diguanylate cyclase PleD. J Bacteriol. 198, 147-56. doi: 10.1128/JB.00742-15
8. Rinaldo S*, Paiardini A*, Stelitano V, Brunotti P, Cervoni L, Fernicola S, Protano C, Vitali M, Cutruzzolà F, Giardina G. The structural basis of functional diversification of HD-GYP domain revealed by the Pseudomonas aeruginosa PA478 protein displaying an unselective bi-metallic binding site. J Bacteriol. 197, 1525-35. doi: 10.1128/JB.02606-14
9. Paiardini A, Fiascarelli A, Rinaldo S, Daidone F, Giardina G, Koes DR, Parroni A, Montini G, Marani M, Paone A, McDermott LA, Contestabile R, Cutruzzolà F. Screening and In Vitro Testing of Antifolate Inhibitors of Human Cytosolic SerineHydroxymethyltransferase. ChemMedChem. 10, 490-7. doi: 10.1002/cmdc.201500028
10. Giardina G, Brunotti P, Fiascarelli A, Cicalini A, Costa MG, Buckle AM, di Salvo ML, Giorgi A, Marani M, Paone A, Rinaldo S, Paiardini A, Contestabile R, Cutruzzolà F. (2015) How pyridoxal 5'-phosphate differentially regulates human cytosolic and mitochondrial serine hydroxymethyltransferase oligomeric state. FEBS J. 282, 1225-41. doi: 10.1111/febs.13211
11. Paone A, Marani M, Fiascarelli A, Rinaldo S, Giardina G, Contestabile R, Paiardini A, Cutruzzolà F (2014) SHMT1 knockdown induces apoptosis in lung cancer cells by causing uracil misincorporation. Cell Death and Disease. 5, e1525. doi: 10.1038/cddis.2014.482 5,014
12. Rinaldo S, Giardina G, Cutruzzolà F. (2014) Nitrosylation of c heme in cd(1)-nitrite reductase is enhanced during catalysis. Biochem Biophys Res Commun. 451, 449-54. doi: 10.1016/j.bbrc.2014.08.020
13. Cutruzzolà F, Arcovito A, Giardina G, Della Longa S, D'Angelo P, Rinaldo S. (2014) Distal-proximal crosstalk in the heme binding pocket of the NO sensor DNR. Biometals. 27, 763-73. doi: 10.1007/s10534-014-9770-3
14. Paiardini A, Aducci P, Cervoni L, Cutruzzolà F, Di Lucente C, Janson G, Pascarella S, Rinaldo S, Visconti S, Camoni L, (2014) The phytotoxin fusicoccin differently regulates 14-3-3 proteins association to mode III targets. IUBMB Life 66, 52-62. doi: 10.1002/iub.1239
15. Giardina G, Paiardini A, Fernicola S, Franceschini S, Rinaldo S, Stelitano V, Cutruzzolà F, (2013) Investigating the allosteric regulation of YfiN from Pseudomonas aeruginosa: clues from the structure of the catalytic domain. PLoS ONE 8 (11): e81324. doi: 10.1371/journal.pone.0081324
16. Stelitano V, Giardina G, Paiardini A, Castiglione N, Cutruzzolà F, Rinaldo S, (2013) C-di-GMP Hydrolysis by Pseudomonas aeruginosa HD-GYP Phosphodiesterases: Analysis of the Reaction Mechanism and Novel Roles for pGpG. PLoS ONE 8(9): e74920. doi: 10.1371/journal.pone.0074920
17. Antoniani D, Rossi E, Rinaldo S, Bocci P, Lolicato M, Paiardini A, Raffaelli N, Cutruzzolà F and Landini P. (2013) The immunosuppressive drug azathioprine inhibits biosynthesis of the bacterial signal molecule cyclic-di-GMP by interfering with intracellular nucleotide pool availability. Applied Microbiology and Biotechnology. 97, 7325-36. doi: 10.1007/s00253-013-4875-0
18. Stelitano V, Brandt A, Fernicola S, Franceschini S, Giardina G, Pica A, Rinaldo S, Sica F, Cutruzzolà F. (2013) Probing the activity of diguanylate cyclases and c-di-GMP phosphodiesterases in real-time by CD spectroscopy. Nucleic Acids Res. 41(7):e79. doi: 10.1093/nar/gkt028
19. Radoul M., Barak Y., Rinaldo S., Cutruzzolà F., Pecht I., Goldfarb D. (2012) Solvent Accessibility in the Distal Heme Pocket of the Nitrosyl d1-Heme Complex of Pseudomonas Stutzeri cd1 Nitrite Reductase. Biochemistry. 51, 9192-201. doi: 10.1021/bi3011237
20. Chi C.N., Haq S.R., Rinaldo S., Dogan J., Cutruzzolà F., Engström A., Gianni S., Lundström P., Jemth P. (2012) Interactions outside the Boundaries of the Canonical Binding Groove of a PDZ Domain Influence Ligand Binding. Biochemistry. 51, 8971-9. doi: 10.1021/bi300792h
21. Rinaldo S.*, Castiglione N.*, Giardina G., Caruso M., Arcovito A., Della Longa S., D'Angelo P., and Cutruzzola' F. (2012) Unusual heme binding properties of the dissimilative nitrate respiration regulator (DNR), a bacterial nitric oxide sensor. Antioxid Redox Signal. 17, 1178-89. doi: 10.1089/ars.2011.4226
22. Castiglione N.*, Rinaldo S.*, Giardina G., Stelitano V., and Cutruzzola' F. (2012) Nitrite and Nitrite Reductases: From Molecular Mechanisms to Significance in Human Health and Disease. Antioxid Redox Signal. 17, 684-716. doi: 10.1089/ars.2011.4196
23. Castiglione N., Stelitano V., Rinaldo S., Giardina G., Caruso M. and Cutruzzola' F. (2011) Metabolism of cyclic-di-GMP in bacterial biofilms: From a general overview to biotechnological applications. Indian Journal of Biotechnology 10, 423-431. ISSN: 0972-5849
24. Giardina G, Castiglione N, Caruso M, Cutruzzola' F, Rinaldo S. (2011) The Pseudomonas aeruginosa DNR transcription factor: light and shade of nitric oxide-sensing mechanisms. Biochem Soc Trans. 39, 294-8. doi: 10.1042/BST0390294
25. Rinaldo S, Giardina G, Castiglione N, Stelitano V, Cutruzzola' F. (2011) The catalytic mechanism of Pseudomonas aeruginosa cd1 nitrite reductase. Biochem Soc Trans. 39, 195-200. doi: 10.1042/bst0390195
26. Daidone, F., Florio, R., Rinaldo, S., Contestabile, R., di Salvo, M.L., Cutruzzola', F., Bossa, F., Paiardini, A. (2011) In Silico and in Vitro Validation of Serine Hydroxymethyltransferase as a Chemoterapeutic Target of the Antifolate Drug Pemetrexed. Eur J Med Chem. 46, 1616-21. doi: 10.1016/j.ejmech.2011.02.009
27. Radoul, M., Bykov, D., Rinaldo, S., Cutruzzola', F., Neese F., Goldfarb D. (2011) Dynamic hydrogen bonding network in the distal pocket of the nitrosyl complex of Pseudomonas aeruginosa cd1 nitrite reductase. J. Am. Chem. Soc. 133, 3043-55. doi: 10.1021/ja109688w
28. Rinaldo S.*, Sam.K.A.*, Castiglione N., Stelitano, V., Arcovito A., Allen, J., Brunori M., Ferguson, S.J., Cutruzzola' F. (2011) Observation of fast release of NO from ferrous d1 haem allows formulation of a unified reaction mechanism for cytochrome cd1 nitrite reductases. Biochem J. 435, 217-25. doi: 10.1042/bj20101615
29. Cutruzzola' F., Rinaldo S., Castiglione N., Giardina G., Pecht I., Brunori M., (2009) Nitrite reduction: a ubiquitous function from a pre-aerobic past. Bioessays. 31, 885-91. doi: 10.1002/bies.200800235
30. Castiglione N., Rinaldo S., Giardina G., Cutruzzola' F., (2009) The transcription factor DNR from Pseudomonas aeruginosa specifically requires nitric oxide and haem for the activation of a target promoter in Escherichia coli. Microbiology. 155, 2838-44. doi: 10.1099/mic.0.028027-0
31. Giardina G., Rinaldo S., Castiglione N., Caruso M., Cutruzzola' F., (2009) A dramatic conformational rearrangement is necessary for the activation of DNR from Pseudomonas aeruginosa. Crystal structure of wild-type DNR. Proteins. 77, 174-80. doi: 10.1002/prot.22428
32. Radoul, M., Centola, F., Rinaldo, S., Cutruzzola', F., Pecht, I., Goldfarb, D. (2009) The d1 heme-nitrosyl complex of cd1 nitrite reductase and its Y10F mutant studied by high field pulse EPR spectroscopy. Inorganic Chemistry. 18, 3913-5. doi: 10.1021/ic802355y
33. Farver O., Brunori, M., Cutruzzola', F., Rinaldo, S., Wherland, S., Pecht, I., (2009) Intramolecular electron-transfer in Pseudomonas aeruginosa cd1 nitrite reductase - thermodynamics and kinetics. Biophys J. 96, 2849-56. doi: 10.1016/j.bpj.2008.12.3937
34. Rinaldo S., Arcovito A., Giardina G., Castiglione N., Brunori M., Cutruzzola' F. (2008) New insights into the activity of Pseudomonas aeruginosa cd(1) nitrite reductase. Biochem Soc Trans. 36, 1155-1159. doi: 10.1042/BST0361155
35. Giardina, G.*, Rinaldo, S.*, Johnson, K.A., Di Matteo, A., Brunori, M., Cutruzzola', F., (2008) NO-sensing in Pseudomonas aeruginosa: structure of the transcriptional regulator DNR, J Mol Biol. 378, 1002-15. doi: 10.1016/j.jmb.2008.03.013
36. Rinaldo, S., Brunori, M., Cutruzzola', F., (2007) Ancient hemes for ancient catalysts. Plant signaling and behavior, 3, 135-136. doi: 10.4161/psb.3.2.5052
37. Rinaldo, S., Brunori, M., Cutruzzola, F. (2007) Nitrite controls the release of nitric oxide in Pseudomonas aeruginosa cd(1) nitrite reductase. Biochem Biophys Res Commun. 363, 662-6. doi: 10.1016/j.bbrc.2007.09.036
38. Rinaldo, S., Arcovito, A., Brunori, M., Cutruzzola' , F. (2007) Fast dissociation of nitric oxide from ferrous Pseudomonas aeruginosa CD1 nitrite reductase: a novel outlook on the catalytic mechanism. J Biol Chem. 282, 14761-67. doi: 10.1074/jbc.M700933200
39. Svistunenko DA, Reeder BJ, Wankasi MM, Silaghi-Dumitrescu RL, Cooper CE, Rinaldo S, Cutruzzola F, Wilson MT. (2007) Reaction of Aplysia limacina metmyoglobin with hydrogen peroxide. Dalton Trans. 28, 840-50. doi: 10.1039/b615770j
40. Centola F*, Rinaldo S*, Brunori M, Cutruzzola F. (2006) Critical role of His369 in the reactivity of Pseudomonas aeruginosa cytochrome cd1 nitrite reductase with oxygen. FEBS J. 273, 4495-503. doi: 10.1111/j.1742-4658.2006.05455.x
41. Rinaldo S, Giardina G, Brunori M, Cutruzzola F. (2006) N-oxide sensing and denitrification: the DNR transcription factors. Biochem Soc Trans. 34, 185-7. Review. doi: 10.1042/bst0340185
42. Rinaldo S, Giardina G, Brunori M, Cutruzzola F. (2005) N-oxide sensing in Pseudomonas aeruginosa: expression and preliminary characterization of DNR, an FNR-CRP type transcriptional regulator. Biochem Soc Trans. 33, 184-6. doi: 10.1042/BST0330184
43. Cutruzzola' F, Rinaldo S, Centola F, Brunori M, (2003) NO production by Pseudomonas aeruginosa cd1 nitrite reductase. IUBMB Life 55, 617-21. doi: 10.1080/15216540310001628672
Capitolo di libri
1. Rinaldo, S. and Cutruzzola', F. (2007) 'Nitrite reductases in denitrification' in Biology of the Nitrogen Cycle edited by H. Bothe, S. J. Ferguson and W. E. Newton, Elsevier (Amsterdam, The Netherlands) p.37-55.
2. Rinaldo, S., Giardina, G., Cutruzzolà, F. CHAPTER 4: Nitrite Reductase - Cytochrome cd1 (2017) RSC Metallobiology, 2017-January (9), pp. 59-90.
Ai sensi dell’art. 10 della Legge sulla privacy 675/96, art. 11 e 20 e successive modifiche, la sottoscritta Serena Rinaldo autorizza il trattamento dei dati personali contenuti nel proprio CV.
Consapevole della responsabilità penale prevista, dall’art. 76 del D.P.R. 445/2000, per le ipotesi di falsità in atti e dichiarazioni mendaci ivi indicate.
Roma 29 Marzo 2017
Il Dichiarante
SERENA RINALDO