Notizie
- BIOINFORMATICA - LM BGIA (AA 2024-2025)
Il corso inizia il giorno Lunedì 07/10/2024 ore 14:00 presso l'aula informatizzata dell'edificio cu010.
Proseguirà con orario Lun-Mar 14:00-16:00
Il materiale didattico è reperibile al link https://elearning.uniroma1.it/course/view.php?id=309
Frequenza non obbligatoria.
Modalità didattica in presenza (secondo le disposizioni del Senato Acccademico)
- CHIMICA BIOLOGICA 2 canale - LT Scienze biologiche (AA 2024-2025)
Il corso inizierà Martedì 4 marzo ore 9:00 Aula SERGI CU026
Proseguirà con l'orario Mar 9:00-11:00; Mer 15:00-17:00; Ven 11:00-13:00 nella medesima aula
Il materiale didattico è reperibile al link https://elearning.uniroma1.it/course/view.php?id=1513
Frequenza non obbligatoria
Modalità didattica in presenza.
- LABORATORIO di BIOINFORMATICA - LT Scienze biologiche (AA 2024-2025)
Il corso inizierà il giorno 27 febbraio alle ore 16:00 presso l'aula informatizzata CU010
Proseguirà con l'orario Mar-Gio 16:00-18:00 nella stessa aula
Il materiale didattico è reperibile al link https://elearning.uniroma1.it/course/view.php?id=715
Frequenza non obbligatoria
Modalità didattica in presenza
Orari di ricevimento
Si riceve per appuntamento richiesto tramite posta elettronica
Curriculum
Professore ordinario BIO/10
Dipartimento di Scienze biochimiche "A. Rossi Fanelli"
Sapienza Università di Roma
00185 Roma
e-mail: Stefano.Pascarella@uniroma1.it
ESPERIENZA LAVORATIVA
2001-oggi: Professore ordinario BIO/10; Sapienza Università di Roma; Attività di insegnamento e ricerca: Biochimica, Bioinformatica Strutturale
2000-2001: Professore Associato BIO/10; Sapienza Università di Roma; Attività di insegnamento e ricerca: Biochimica, Bioinformatica Strutturale
1991-2000: Ricercatore BIO/10; Sapienza Università di Roma; Attività di insegnamento e ricerca: Biochimica, Bioinformatica strutturale
1990-1991: Post-doc fellow (European Community Fellowship; EMBO Fellowship). EMBL - Heidelberg; divisione Biocomputing. Attività di ricerca: Bioinformatica strutturale
1989 (1 m): Visiting fellow; Dipartimento di Biochimica, Medical College of Virginia, Richmond, Virginia, USA. Attività di ricerca: Biochimica
1985 (3 m): Visiting fellow; Dipartimento di Biochimica, Medical College of Virginia, Richmond, Virginia, U.S.A. Attività di ricerca: Biochimica
ISTRUZIONE E FORMAZIONE
1986-1989: Dottorato di ricerca in Biochimica, Università di Roma, La Sapienza
Progetto: Mutagenesi sito-specifica della serina idrossimetiltransferasi
1984: Laurea in Scienze biologiche, 110/110 e lode, Università di Roma, La Sapienza
Progetto: Determinazione della struttura primaria della SHMT citosolica di coniglio
1978: Maturità classica
Liceo Ginnasio Statale Luciano Manara, Roma, Italia
COMPETENZE PERSONALI
Lingua madre: italiano
Altre lingue:
Ascolto Lettura Parlato Scritto
Inglese B1 C1 B1 B2
ATTIVITÀ ORGANIZZATIVE E DIDATTICHE
- Tutor di studenti laureandi, di dottorato, e post-dottorato
- Co-fondatore e componente del Collegio dei Docenti del Master annuale in Bioinformatica (2001-2016)
- Direttore del Master in Bioinformatica (2010-2016)
- Componente di commissioni Dipartimentali
- Componente del Collegio dei Docenti del Dottorato in Biofisica (fino al 2013)
- Componente del Collegio dei Docenti del Dottorato in Biochimica (dal 2015)
- Docente del Corso di Biochimica (Scienze biologiche)
- Docente del corso di Laboratorio di Bioinformatica (Scienze biologiche)
- Docente del Corso di Bioinformatica (Laurea Magistrale in Biotecnologie e Genomica per l’Industria e l’Ambiente)
- Direttore del Corso Avanzato di Formazione in Bioinformatica, Sapienza, 2022-2024
- Presidente e componente di commissioni di concorso universitario per Ricercatore e Professore
- Presidente e componente di commissioni di concorso presso enti di ricerca (CNR, ISS)
- Coordinatore del Dottorato in Bioinformatica e Biologia Computazionale dal 40° ciclo
COMPETENZE TECNICHE e SCIENTIFICHE
- Bioinformatica strutturale; Grafica molecolare; Biologia computazionale
- Programmazione con linguaggi Perl, C e bash scripting. Sistemi operativi: Mac OS-X, Linux, MS Windows. Linguaggio R, Python
FINANZIAMENTI
- Principal Investigator di progetti di ricerca dell'Università Sapienza;
- Partecipante a progetti di ricerca nazionali (PRIN);
- Partecipante a progetti Cenci-Bolognetti;
- Principale ricercatore del PNRA (Progetto Nazionale Ricerca Antartide) 2004 1.8
- Partecipante al "Progetto FILAS 2016 Regione Lazio".
- Responsabile dell'unità di ricerca nel "Consorzio Medulloblastoma" finanziato da LazioInnova (2018-2020).
- Partecipante al consorzio europeo ERDERA sulle malattie rare
ALTRE ATTIVITÀ
- Referee per riviste scientifiche internazionali: AminoAcids; BBA; Bioinformatics; BMC Structural biology; Computational biology and chemistry; Current microbiology; Genome Biology and Evolution; Gene; Interdisciplinary sciences: computational life sciences; J Computer Aided Molecular Design; Microbial genomics; Molecular BioSystems; Plos ONE; Scientific Report; European Journal of Biochemistry; FEBS journal; Comparative Biochemistry and Physiology; Journal of Medical Virology; Virology; Virus research; Frontiers in Bioinformatics
- Componente del comitato di valutazione delle biotecnologie nell'ambito del IV PQ della Commissione europea
- Referente per la valutazione di progetti scientifici (Norvegia, Polonia);
- Referente per la valutazione di progetti nazionali (PRIN)
- Componenrte del comitato di programma dei convegni BITS2012, BITS2013, BITS2014;
- Editore associato del supplemento BITS di BMC Bioinformatics (2012, 2013, 2014);
- Componente del comitato editoriale di Biochemistry Research International, Wiley
- Componente del comitato editoriale di BioMed Research International, Wiley
- Guest editor del numero speciale Symmetry: "Structural Symmetry and Protein Function" (Simmetria strutturale e funzione delle proteine), MDPI Publishing.
- Membro del Comitato Editoriale di Open Life Sciences, De Gruyter Publishing
- Delegato della Sapienza presso il Consiglio di amministrazione di ELIXIR-IIB (dal 2017).
CONTRIBUTI ORALI SU INVITO
- VI Convegno nazionale "Proteine '91", Trieste
- "Vitamina B6 e catalisi carbonilica", Capri, 22-27 maggio 1994
- Scuola Nazionale di Scienza delle Proteine (Urbino, 5-9 settembre 1994)
- Scuola Nazionale di Scienza delle Proteine (Urbino, 18-22 settembre 1995)
- Scuola di Struttura e Funzione delle Proteine (L'Aquila, 25-27 maggio 2000)
- Corso "Bioinformatica", IST, Genova 1-2 luglio, 2004
- Riunione SIB-BIB 2000 "Biochimica e Biotecnologie", Como, 27-29 giugno 2000
- XVII Convegno Nazionale SIB "Proteine 2004", Viterbo, 20-22 maggio 2004
- Conferenza, Dipartimento di Biotecnologie e Bioscienze - Università degli Studi di Milano "Bicocca", 15 dic. 2004
- Workshop SIB "Biologia Computazionale e di Sistema", Bologna, 28 giugno 2017
SOCIETÁ SCIENTIFICHE
SIB, Società Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare
BIBLIOMETRIA
(Scopus, Aprile 2025)
H-index = 32
Totale citazioni = 4125
Numero di pubblicazioni = 126