Obiettivi

Il corso affronta gli aspetti chimico farmaceutici che sono alla base
dell'azione dei farmaci, le relazioni struttura-attività e la
progettazione razionale. Verranno inoltre trattati selezionati argomenti
monografici.

Canali

NESSUNA CANALIZZAZIONE

RINO RAGNO RINO RAGNO   Scheda docente

Programma

Cenni di Chimica Organica e Biochimica
1. riconoscimento di gruppi funzionali da strutture 2D e 3D
2. riconoscimento di aminoacidi e acidi nucleici da strutture 2D e 3D
3. Rappresentazione di Molecole in 1D, 2D e 3D
1. SMILES
2. PDB, sdf e Mol2
4. Applicazione
1. Marvin Sketch
2. Web applications
3. UCSF Chimera
Fasi Farmaceutiche
1. Farmaceutica
1.1. Definizioni
2. Farmacocinetica
2.1. Definizioni
2.2. Lipinsky
a) I Parametri di Lipinsky
b) Come si calcolano (esercitazioni pratiche)
2.3. Veber
2.4. Metabolismo
a) Reazioni di Fase I
b) Reazioni di Fase II
3. Farmacodinamica
3.1. Definizioni
3.2. Interazioni Farmaco/Recettore
a) Visualizzazione grafica (esercitazioni pratiche)
Drug Discovery
Metodi Classici in Chimica Farmaceutica
1.1. Relazioni Struttura-Attività (SAR)
1.2. Progettazione di Analoghi
a) Selective Optimization of Side Activities (SOSA)
b) Fragment-based lead discovery
c) Serie Omologhe
d) Vinilogia
e) Ligandi doppi
f) Isosteria
g) Scaffold Hopping
Computer Drug Design
1. LBDD
1.1. Similarità Molecolare
a) Descrizione di una molecola
• Chimicamente (Parametri)
• Strutturalmente (Fingerprints)
b) Similarità Chimica
c) Similarità Molecolare
d) Valutazione della Similarità
1.2. Approccio Farmacoforico
a) Panoramica e Teoria
b) Ligand Scout (esercitazioni pratiche)
c) Free/open source Software
d) Applicazione
1.3. QSAR
a) Storia
b) Il metodo Hansch/Fujita (Linear Free Enrgy Relationships)
c) Il metodo Free-Wilson (Structure-Activity Relationships)
d) QSAR Avanzata
• Analisi delle componenti principali (PCA)
• Metodo Projection of Latent Structures (PLS)
e) QSAR con Microsoft Excel/Gnumeric/Libreoffice (esercitazioni pratiche)
f) QSAR con free/open source software (esercitazioni pratiche)
g) Applicazione della QSAR
1.4. 3-D QSAR
a) L’approccio GRID di Goodford
b) Sovrapposizione/allineamento di molecole
c) Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA)
d) 3-D QSAR con free/open source (esercitazioni pratiche)
e) 3-D QSAR con applicazioni web (esercitazioni pratiche)
2. Cenni di SBDD

Testi adottati

- Foye. Principles of medicinal chemistry.6-Ed.2007
- Patrick. An Introduction to Medicinal Chemistry.4-Ed.2009
- Burger. Drug Discovery
- Wermuth. The Practice of Medicinal Chemistry, Third Edition
- Comprehensive Medicinal Chemistry II
- Appunti di lezione e tutorial disponibili sulla piattaforma web e-learning (https://elearning.uniroma1.it/course/view.php?id=381)

Prerequisiti

Lo studente dovrebbe aver acquisito le conoscenze di chimica organica e di biochimica svolte nei corsi precedenti

Modalità di valutazione

Lo studente viene inizialmente valutato con una prova pratico/scritta al calcolatore in cui dimostra di aver appreso le nozioni imparate durante le esercitazioni. La prova scritta si fonde con nozioni teoriche.
Passata la prova scritta lo studente viene interrogato sulle nozioni fornite durante il corso.
Durante il corso potranno essere assegnati dei piccoli compiti per la valutazione in itinere della partecipazione attiva e ne sarà tenuto conto per la valutazione finale.

Data inizio prenotazione Data fine prenotazione Data appello
16/12/2020 08/01/2021 12/01/2021
13/01/2020 11/02/2021 16/02/2021
05/02/2020 01/03/2021 05/03/2021
01/03/2020 10/04/2021 13/04/2021
14/04/2020 20/05/2021 25/05/2021
26/05/2020 10/06/2021 15/06/2021
16/06/2020 01/07/2021 06/07/2021
07/07/2021 02/09/2021 07/09/2021
08/07/2021 30/09/2021 05/10/2021
08/10/2021 04/11/2021 09/11/2021
15/11/2021 05/12/2021 14/12/2021
16/12/2021 05/01/2022 11/01/2022
Scheda insegnamento
  • Anno accademico: 2020/2021
  • Curriculum: Curriculum unico
  • Anno: Terzo anno
  • Semestre: Primo semestre
  • Insegnamento:
    1023914 - CHIMICA FARMACEUTICA E TECNOLOGIE FARMACEUTICHE
  • SSD: CHIM/08
  • CFU: 5
Caratteristiche
  • Attività formative caratterizzanti
  • Ambito disciplinare: Discipline biotecnologiche con finalità specifiche:chimiche e farmaceutiche
  • Ore esercitazioni: 20
  • Ore Aula: 32
  • CFU: 5.00
  • SSD: CHIM/08